Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPTBN4Q9H254 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPTBN4Q9H254 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPTBN4Q9H254 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPTBN4Q9H254 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTBN4Q9H254 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTBN4Q9H254 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPTBN4Q9H254 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTBN4Q9H254 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTBN4Q9H254 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPTBN4Q9H254 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPTBN4Q9H254 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPTBN4Q9H254 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPTBN4Q9H254 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTBN4Q9H254 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTBN4Q9H254 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTBN4Q9H254 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPTBN4Q9H254 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPTBN4Q9H254 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPTBN4Q9H254 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPTBN4Q9H254 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTBN4Q9H254 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTBN4Q9H254 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTBN4Q9H254 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTBN4Q9H254 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SPTBN4Q9H254 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPTBN4Q9H254 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPTBN4Q9H254 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPTBN4Q9H254 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPTBN4Q9H254 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SPTBN4Q9H254 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPTBN4Q9H254 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTBN4Q9H254 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTBN4Q9H254 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTBN4Q9H254 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTBN4Q9H254 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SPTBN4Q9H254 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPTBN4Q9H254 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPTBN4Q9H254 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SPTBN4Q9H254 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTBN4Q9H254 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTBN4Q9H254 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTBN4Q9H254 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTBN4Q9H254 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTBN4Q9H254 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTBN4Q9H254 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTBN4Q9H254 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTBN4Q9H254 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SPTBN4Q9H254 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPTBN4Q9H254 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPTBN4Q9H254 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPTBN4Q9H254 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPTBN4Q9H254 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTBN4Q9H254 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTBN4Q9H254 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPTBN4Q9H254 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPTBN4Q9H254 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPTBN4Q9H254 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTBN4Q9H254 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTBN4Q9H254 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTBN4Q9H254 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPTBN4Q9H254 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPTBN4Q9H254 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPTBN4Q9H254 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPTBN4Q9H254 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPTBN4Q9H254 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPTBN4Q9H254 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPTBN4Q9H254 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPTBN4Q9H254 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SPTBN4Q9H254 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPTBN4Q9H254 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SPTBN4Q9H254 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTBN4Q9H254 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTBN4Q9H254 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPTBN4Q9H254 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTBN4Q9H254 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPTBN4Q9H254 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPTBN4Q9H254 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPTBN4Q9H254 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPTBN4Q9H254 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SPTBN4Q9H254 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPTBN4Q9H254 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPTBN4Q9H254 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPTBN4Q9H254 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPTBN4Q9H254 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPTBN4Q9H254 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPTBN4Q9H254 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPTBN4Q9H254 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SPTBN4Q9H254 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPTBN4Q9H254 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SPTBN4Q9H254 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPTBN4Q9H254 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPTBN4Q9H254 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTBN4Q9H254 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPTBN4Q9H254 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPTBN4Q9H254 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPTBN4Q9H254 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPTBN4Q9H254 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPTBN4Q9H254 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPTBN4Q9H254 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms