Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX6-2Q9C056 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX6-2Q9C056 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX6-2Q9C056 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX6-2Q9C056 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX6-2Q9C056 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX6-2Q9C056 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX6-2Q9C056 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX6-2Q9C056 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX6-2Q9C056 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX6-2Q9C056 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX6-2Q9C056 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX6-2Q9C056 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX6-2Q9C056 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX6-2Q9C056 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX6-2Q9C056 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-2Q9C056 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-2Q9C056 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX6-2Q9C056 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX6-2Q9C056 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX6-2Q9C056 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX6-2Q9C056 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX6-2Q9C056 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKX6-2Q9C056 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKX6-2Q9C056 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX6-2Q9C056 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX6-2Q9C056 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX6-2Q9C056 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKX6-2Q9C056 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKX6-2Q9C056 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX6-2Q9C056 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKX6-2Q9C056 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKX6-2Q9C056 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKX6-2Q9C056 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX6-2Q9C056 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NKX6-2Q9C056 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX6-2Q9C056 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-2Q9C056 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-2Q9C056 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX6-2Q9C056 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX6-2Q9C056 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX6-2Q9C056 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX6-2Q9C056 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKX6-2Q9C056 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKX6-2Q9C056 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX6-2Q9C056 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX6-2Q9C056 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX6-2Q9C056 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX6-2Q9C056 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX6-2Q9C056 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX6-2Q9C056 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX6-2Q9C056 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX6-2Q9C056 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX6-2Q9C056 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX6-2Q9C056 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX6-2Q9C056 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX6-2Q9C056 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX6-2Q9C056 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX6-2Q9C056 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX6-2Q9C056 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX6-2Q9C056 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX6-2Q9C056 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX6-2Q9C056 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX6-2Q9C056 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX6-2Q9C056 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX6-2Q9C056 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX6-2Q9C056 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms