Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD5

CNFN, Cornifelin, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNFNQ9BYD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNFNQ9BYD5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNFNQ9BYD5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNFNQ9BYD5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNFNQ9BYD5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNFNQ9BYD5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNFNQ9BYD5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNFNQ9BYD5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNFNQ9BYD5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNFNQ9BYD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNFNQ9BYD5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNFNQ9BYD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNFNQ9BYD5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNFNQ9BYD5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNFNQ9BYD5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNFNQ9BYD5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNFNQ9BYD5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNFNQ9BYD5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNFNQ9BYD5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNFNQ9BYD5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNFNQ9BYD5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNFNQ9BYD5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNFNQ9BYD5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNFNQ9BYD5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNFNQ9BYD5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNFNQ9BYD5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNFNQ9BYD5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNFNQ9BYD5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNFNQ9BYD5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNFNQ9BYD5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNFNQ9BYD5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNFNQ9BYD5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNFNQ9BYD5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNFNQ9BYD5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNFNQ9BYD5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNFNQ9BYD5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CNFNQ9BYD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNFNQ9BYD5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNFNQ9BYD5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNFNQ9BYD5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNFNQ9BYD5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNFNQ9BYD5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNFNQ9BYD5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNFNQ9BYD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNFNQ9BYD5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNFNQ9BYD5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNFNQ9BYD5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNFNQ9BYD5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNFNQ9BYD5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNFNQ9BYD5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNFNQ9BYD5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNFNQ9BYD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNFNQ9BYD5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNFNQ9BYD5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNFNQ9BYD5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNFNQ9BYD5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNFNQ9BYD5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CNFNQ9BYD5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CNFNQ9BYD5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CNFNQ9BYD5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CNFNQ9BYD5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CNFNQ9BYD5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CNFNQ9BYD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNFNQ9BYD5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNFNQ9BYD5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CNFNQ9BYD5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNFNQ9BYD5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CNFNQ9BYD5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNFNQ9BYD5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNFNQ9BYD5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms