Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAF4Q9BUZ4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF4Q9BUZ4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF4Q9BUZ4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF4Q9BUZ4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF4Q9BUZ4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF4Q9BUZ4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF4Q9BUZ4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF4Q9BUZ4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF4Q9BUZ4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF4Q9BUZ4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF4Q9BUZ4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF4Q9BUZ4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF4Q9BUZ4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF4Q9BUZ4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF4Q9BUZ4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF4Q9BUZ4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF4Q9BUZ4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF4Q9BUZ4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF4Q9BUZ4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF4Q9BUZ4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF4Q9BUZ4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF4Q9BUZ4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF4Q9BUZ4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF4Q9BUZ4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF4Q9BUZ4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF4Q9BUZ4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF4Q9BUZ4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF4Q9BUZ4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF4Q9BUZ4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF4Q9BUZ4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF4Q9BUZ4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF4Q9BUZ4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF4Q9BUZ4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF4Q9BUZ4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAF4Q9BUZ4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF4Q9BUZ4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF4Q9BUZ4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF4Q9BUZ4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF4Q9BUZ4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF4Q9BUZ4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF4Q9BUZ4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF4Q9BUZ4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF4Q9BUZ4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF4Q9BUZ4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF4Q9BUZ4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAF4Q9BUZ4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF4Q9BUZ4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF4Q9BUZ4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF4Q9BUZ4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF4Q9BUZ4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF4Q9BUZ4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF4Q9BUZ4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF4Q9BUZ4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF4Q9BUZ4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF4Q9BUZ4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF4Q9BUZ4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF4Q9BUZ4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF4Q9BUZ4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF4Q9BUZ4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF4Q9BUZ4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF4Q9BUZ4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF4Q9BUZ4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF4Q9BUZ4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF4Q9BUZ4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF4Q9BUZ4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF4Q9BUZ4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF4Q9BUZ4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF4Q9BUZ4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF4Q9BUZ4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF4Q9BUZ4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF4Q9BUZ4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF4Q9BUZ4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF4Q9BUZ4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF4Q9BUZ4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF4Q9BUZ4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF4Q9BUZ4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF4Q9BUZ4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF4Q9BUZ4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF4Q9BUZ4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF4Q9BUZ4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF4Q9BUZ4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF4Q9BUZ4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAF4Q9BUZ4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAF4Q9BUZ4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAF4Q9BUZ4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAF4Q9BUZ4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAF4Q9BUZ4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAF4Q9BUZ4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF4Q9BUZ4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAF4Q9BUZ4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF4Q9BUZ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF4Q9BUZ4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF4Q9BUZ4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF4Q9BUZ4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAF4Q9BUZ4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF4Q9BUZ4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAF4Q9BUZ4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms