Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFHD1Q9BUP0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFHD1Q9BUP0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFHD1Q9BUP0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EFHD1Q9BUP0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EFHD1Q9BUP0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EFHD1Q9BUP0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EFHD1Q9BUP0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EFHD1Q9BUP0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EFHD1Q9BUP0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EFHD1Q9BUP0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFHD1Q9BUP0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFHD1Q9BUP0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFHD1Q9BUP0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFHD1Q9BUP0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EFHD1Q9BUP0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EFHD1Q9BUP0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EFHD1Q9BUP0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EFHD1Q9BUP0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFHD1Q9BUP0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFHD1Q9BUP0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFHD1Q9BUP0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFHD1Q9BUP0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFHD1Q9BUP0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFHD1Q9BUP0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFHD1Q9BUP0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFHD1Q9BUP0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFHD1Q9BUP0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFHD1Q9BUP0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EFHD1Q9BUP0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFHD1Q9BUP0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFHD1Q9BUP0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EFHD1Q9BUP0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EFHD1Q9BUP0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EFHD1Q9BUP0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFHD1Q9BUP0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFHD1Q9BUP0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EFHD1Q9BUP0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EFHD1Q9BUP0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EFHD1Q9BUP0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EFHD1Q9BUP0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EFHD1Q9BUP0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EFHD1Q9BUP0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EFHD1Q9BUP0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EFHD1Q9BUP0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EFHD1Q9BUP0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EFHD1Q9BUP0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EFHD1Q9BUP0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EFHD1Q9BUP0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EFHD1Q9BUP0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EFHD1Q9BUP0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EFHD1Q9BUP0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EFHD1Q9BUP0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EFHD1Q9BUP0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EFHD1Q9BUP0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EFHD1Q9BUP0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EFHD1Q9BUP0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EFHD1Q9BUP0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EFHD1Q9BUP0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EFHD1Q9BUP0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EFHD1Q9BUP0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EFHD1Q9BUP0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EFHD1Q9BUP0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EFHD1Q9BUP0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFHD1Q9BUP0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFHD1Q9BUP0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EFHD1Q9BUP0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFHD1Q9BUP0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFHD1Q9BUP0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFHD1Q9BUP0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFHD1Q9BUP0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFHD1Q9BUP0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFHD1Q9BUP0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFHD1Q9BUP0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFHD1Q9BUP0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFHD1Q9BUP0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFHD1Q9BUP0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFHD1Q9BUP0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFHD1Q9BUP0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFHD1Q9BUP0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EFHD1Q9BUP0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EFHD1Q9BUP0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EFHD1Q9BUP0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EFHD1Q9BUP0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms