Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPKQ9BS16 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CENPKQ9BS16 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPKQ9BS16 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPKQ9BS16 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPKQ9BS16 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPKQ9BS16 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPKQ9BS16 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPKQ9BS16 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPKQ9BS16 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPKQ9BS16 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPKQ9BS16 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPKQ9BS16 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPKQ9BS16 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPKQ9BS16 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPKQ9BS16 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPKQ9BS16 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPKQ9BS16 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPKQ9BS16 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPKQ9BS16 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPKQ9BS16 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPKQ9BS16 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPKQ9BS16 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPKQ9BS16 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPKQ9BS16 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPKQ9BS16 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPKQ9BS16 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPKQ9BS16 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CENPKQ9BS16 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPKQ9BS16 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPKQ9BS16 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPKQ9BS16 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPKQ9BS16 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPKQ9BS16 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPKQ9BS16 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPKQ9BS16 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPKQ9BS16 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CENPKQ9BS16 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPKQ9BS16 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPKQ9BS16 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPKQ9BS16 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPKQ9BS16 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPKQ9BS16 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPKQ9BS16 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPKQ9BS16 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPKQ9BS16 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPKQ9BS16 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPKQ9BS16 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPKQ9BS16 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPKQ9BS16 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPKQ9BS16 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPKQ9BS16 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPKQ9BS16 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPKQ9BS16 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPKQ9BS16 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPKQ9BS16 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPKQ9BS16 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPKQ9BS16 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPKQ9BS16 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CENPKQ9BS16 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CENPKQ9BS16 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPKQ9BS16 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CENPKQ9BS16 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPKQ9BS16 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPKQ9BS16 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CENPKQ9BS16 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPKQ9BS16 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CENPKQ9BS16 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPKQ9BS16 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CENPKQ9BS16 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPKQ9BS16 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPKQ9BS16 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CENPKQ9BS16 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPKQ9BS16 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CENPKQ9BS16 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPKQ9BS16 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CENPKQ9BS16 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPKQ9BS16 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPKQ9BS16 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPKQ9BS16 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPKQ9BS16 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPKQ9BS16 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPKQ9BS16 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CENPKQ9BS16 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPKQ9BS16 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPKQ9BS16 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms