Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C20orf78Q9BR46 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C20orf78Q9BR46 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C20orf78Q9BR46 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C20orf78Q9BR46 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C20orf78Q9BR46 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C20orf78Q9BR46 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf78Q9BR46 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C20orf78Q9BR46 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C20orf78Q9BR46 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C20orf78Q9BR46 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C20orf78Q9BR46 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C20orf78Q9BR46 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C20orf78Q9BR46 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C20orf78Q9BR46 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
C20orf78Q9BR46 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C20orf78Q9BR46 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C20orf78Q9BR46 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C20orf78Q9BR46 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C20orf78Q9BR46 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C20orf78Q9BR46 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C20orf78Q9BR46 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C20orf78Q9BR46 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C20orf78Q9BR46 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C20orf78Q9BR46 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C20orf78Q9BR46 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C20orf78Q9BR46 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C20orf78Q9BR46 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C20orf78Q9BR46 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C20orf78Q9BR46 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C20orf78Q9BR46 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C20orf78Q9BR46 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C20orf78Q9BR46 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C20orf78Q9BR46 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C20orf78Q9BR46 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C20orf78Q9BR46 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C20orf78Q9BR46 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms