Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMCHL2Q9BQD1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMCHL2Q9BQD1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PMCHL2Q9BQD1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMCHL2Q9BQD1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMCHL2Q9BQD1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMCHL2Q9BQD1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMCHL2Q9BQD1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMCHL2Q9BQD1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHL2Q9BQD1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHL2Q9BQD1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHL2Q9BQD1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHL2Q9BQD1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMCHL2Q9BQD1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PMCHL2Q9BQD1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PMCHL2Q9BQD1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PMCHL2Q9BQD1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PMCHL2Q9BQD1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PMCHL2Q9BQD1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMCHL2Q9BQD1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMCHL2Q9BQD1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PMCHL2Q9BQD1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PMCHL2Q9BQD1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PMCHL2Q9BQD1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMCHL2Q9BQD1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PMCHL2Q9BQD1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PMCHL2Q9BQD1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PMCHL2Q9BQD1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PMCHL2Q9BQD1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMCHL2Q9BQD1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMCHL2Q9BQD1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PMCHL2Q9BQD1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMCHL2Q9BQD1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMCHL2Q9BQD1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMCHL2Q9BQD1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMCHL2Q9BQD1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PMCHL2Q9BQD1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMCHL2Q9BQD1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PMCHL2Q9BQD1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PMCHL2Q9BQD1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMCHL2Q9BQD1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PMCHL2Q9BQD1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PMCHL2Q9BQD1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PMCHL2Q9BQD1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMCHL2Q9BQD1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMCHL2Q9BQD1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMCHL2Q9BQD1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMCHL2Q9BQD1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PMCHL2Q9BQD1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMCHL2Q9BQD1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PMCHL2Q9BQD1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PMCHL2Q9BQD1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PMCHL2Q9BQD1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PMCHL2Q9BQD1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms