Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3GL3Q99963 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3GL3Q99963 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SH3GL3Q99963 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3GL3Q99963 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SH3GL3Q99963 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SH3GL3Q99963 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SH3GL3Q99963 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SH3GL3Q99963 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SH3GL3Q99963 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SH3GL3Q99963 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SH3GL3Q99963 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3GL3Q99963 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3GL3Q99963 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SH3GL3Q99963 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SH3GL3Q99963 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SH3GL3Q99963 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SH3GL3Q99963 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH3GL3Q99963 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH3GL3Q99963 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3GL3Q99963 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3GL3Q99963 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3GL3Q99963 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3GL3Q99963 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3GL3Q99963 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3GL3Q99963 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3GL3Q99963 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3GL3Q99963 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3GL3Q99963 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3GL3Q99963 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3GL3Q99963 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3GL3Q99963 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3GL3Q99963 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3GL3Q99963 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3GL3Q99963 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3GL3Q99963 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3GL3Q99963 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SH3GL3Q99963 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3GL3Q99963 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3GL3Q99963 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3GL3Q99963 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3GL3Q99963 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3GL3Q99963 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3GL3Q99963 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3GL3Q99963 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3GL3Q99963 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3GL3Q99963 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3GL3Q99963 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3GL3Q99963 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3GL3Q99963 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3GL3Q99963 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3GL3Q99963 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3GL3Q99963 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3GL3Q99963 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3GL3Q99963 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3GL3Q99963 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3GL3Q99963 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3GL3Q99963 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3GL3Q99963 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3GL3Q99963 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3GL3Q99963 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3GL3Q99963 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3GL3Q99963 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3GL3Q99963 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3GL3Q99963 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3GL3Q99963 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3GL3Q99963 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3GL3Q99963 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3GL3Q99963 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3GL3Q99963 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3GL3Q99963 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3GL3Q99963 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3GL3Q99963 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3GL3Q99963 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3GL3Q99963 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3GL3Q99963 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3GL3Q99963 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3GL3Q99963 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3GL3Q99963 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH3GL3Q99963 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3GL3Q99963 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3GL3Q99963 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3GL3Q99963 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3GL3Q99963 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3GL3Q99963 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3GL3Q99963 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3GL3Q99963 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GL3Q99963 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GL3Q99963 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GL3Q99963 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GL3Q99963 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GL3Q99963 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GL3Q99963 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GL3Q99963 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GL3Q99963 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GL3Q99963 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GL3Q99963 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GL3Q99963 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GL3Q99963 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GL3Q99963 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms