Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PITX2Q99697 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITX2Q99697 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITX2Q99697 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PITX2Q99697 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITX2Q99697 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PITX2Q99697 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PITX2Q99697 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITX2Q99697 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PITX2Q99697 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PITX2Q99697 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITX2Q99697 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PITX2Q99697 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITX2Q99697 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITX2Q99697 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PITX2Q99697 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PITX2Q99697 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITX2Q99697 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITX2Q99697 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PITX2Q99697 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PITX2Q99697 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PITX2Q99697 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PITX2Q99697 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PITX2Q99697 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PITX2Q99697 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PITX2Q99697 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITX2Q99697 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITX2Q99697 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITX2Q99697 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PITX2Q99697 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PITX2Q99697 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PITX2Q99697 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PITX2Q99697 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PITX2Q99697 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PITX2Q99697 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITX2Q99697 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITX2Q99697 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITX2Q99697 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITX2Q99697 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITX2Q99697 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PITX2Q99697 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PITX2Q99697 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PITX2Q99697 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PITX2Q99697 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITX2Q99697 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PITX2Q99697 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITX2Q99697 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITX2Q99697 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PITX2Q99697 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITX2Q99697 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITX2Q99697 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITX2Q99697 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITX2Q99697 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PITX2Q99697 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PITX2Q99697 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PITX2Q99697 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PITX2Q99697 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITX2Q99697 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITX2Q99697 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITX2Q99697 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITX2Q99697 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITX2Q99697 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITX2Q99697 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITX2Q99697 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PITX2Q99697 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PITX2Q99697 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITX2Q99697 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITX2Q99697 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITX2Q99697 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITX2Q99697 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITX2Q99697 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITX2Q99697 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PITX2Q99697 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PITX2Q99697 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PITX2Q99697 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PITX2Q99697 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITX2Q99697 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PITX2Q99697 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PITX2Q99697 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PITX2Q99697 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PITX2Q99697 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PITX2Q99697 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PITX2Q99697 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PITX2Q99697 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PITX2Q99697 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PITX2Q99697 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PITX2Q99697 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PITX2Q99697 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITX2Q99697 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITX2Q99697 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITX2Q99697 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITX2Q99697 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITX2Q99697 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PITX2Q99697 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITX2Q99697 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITX2Q99697 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITX2Q99697 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PITX2Q99697 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PITX2Q99697 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PITX2Q99697 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms