Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMC6Q96SB8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMC6Q96SB8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMC6Q96SB8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMC6Q96SB8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMC6Q96SB8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMC6Q96SB8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMC6Q96SB8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMC6Q96SB8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMC6Q96SB8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC6Q96SB8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC6Q96SB8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMC6Q96SB8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMC6Q96SB8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMC6Q96SB8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC6Q96SB8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC6Q96SB8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC6Q96SB8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC6Q96SB8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC6Q96SB8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC6Q96SB8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC6Q96SB8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC6Q96SB8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC6Q96SB8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC6Q96SB8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC6Q96SB8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC6Q96SB8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC6Q96SB8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC6Q96SB8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC6Q96SB8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC6Q96SB8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC6Q96SB8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC6Q96SB8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC6Q96SB8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC6Q96SB8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC6Q96SB8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC6Q96SB8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC6Q96SB8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC6Q96SB8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC6Q96SB8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC6Q96SB8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC6Q96SB8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC6Q96SB8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC6Q96SB8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC6Q96SB8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC6Q96SB8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC6Q96SB8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC6Q96SB8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC6Q96SB8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMC6Q96SB8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC6Q96SB8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC6Q96SB8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMC6Q96SB8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC6Q96SB8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMC6Q96SB8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMC6Q96SB8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC6Q96SB8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMC6Q96SB8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC6Q96SB8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC6Q96SB8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC6Q96SB8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMC6Q96SB8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC6Q96SB8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC6Q96SB8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMC6Q96SB8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMC6Q96SB8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC6Q96SB8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC6Q96SB8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMC6Q96SB8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC6Q96SB8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC6Q96SB8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC6Q96SB8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMC6Q96SB8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMC6Q96SB8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMC6Q96SB8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC6Q96SB8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMC6Q96SB8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMC6Q96SB8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMC6Q96SB8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SMC6Q96SB8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMC6Q96SB8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMC6Q96SB8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMC6Q96SB8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMC6Q96SB8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMC6Q96SB8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC6Q96SB8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMC6Q96SB8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMC6Q96SB8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMC6Q96SB8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMC6Q96SB8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMC6Q96SB8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC6Q96SB8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMC6Q96SB8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC6Q96SB8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC6Q96SB8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMC6Q96SB8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMC6Q96SB8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC6Q96SB8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC6Q96SB8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMC6Q96SB8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 325.8 ms