Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU4

UHRF2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2Q96PU4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF2Q96PU4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UHRF2Q96PU4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UHRF2Q96PU4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UHRF2Q96PU4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UHRF2Q96PU4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UHRF2Q96PU4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UHRF2Q96PU4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UHRF2Q96PU4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UHRF2Q96PU4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UHRF2Q96PU4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UHRF2Q96PU4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UHRF2Q96PU4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF2Q96PU4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UHRF2Q96PU4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UHRF2Q96PU4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UHRF2Q96PU4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UHRF2Q96PU4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UHRF2Q96PU4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UHRF2Q96PU4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UHRF2Q96PU4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UHRF2Q96PU4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UHRF2Q96PU4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UHRF2Q96PU4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UHRF2Q96PU4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UHRF2Q96PU4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UHRF2Q96PU4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UHRF2Q96PU4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UHRF2Q96PU4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UHRF2Q96PU4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UHRF2Q96PU4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UHRF2Q96PU4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UHRF2Q96PU4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UHRF2Q96PU4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UHRF2Q96PU4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UHRF2Q96PU4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UHRF2Q96PU4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UHRF2Q96PU4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UHRF2Q96PU4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UHRF2Q96PU4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UHRF2Q96PU4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UHRF2Q96PU4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UHRF2Q96PU4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UHRF2Q96PU4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UHRF2Q96PU4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UHRF2Q96PU4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF2Q96PU4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UHRF2Q96PU4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UHRF2Q96PU4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UHRF2Q96PU4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UHRF2Q96PU4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UHRF2Q96PU4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UHRF2Q96PU4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UHRF2Q96PU4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UHRF2Q96PU4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UHRF2Q96PU4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UHRF2Q96PU4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UHRF2Q96PU4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UHRF2Q96PU4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF2Q96PU4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF2Q96PU4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UHRF2Q96PU4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UHRF2Q96PU4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UHRF2Q96PU4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF2Q96PU4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UHRF2Q96PU4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF2Q96PU4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF2Q96PU4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UHRF2Q96PU4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF2Q96PU4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms