Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSNARE1Q96NA8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSNARE1Q96NA8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSNARE1Q96NA8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSNARE1Q96NA8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSNARE1Q96NA8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TSNARE1Q96NA8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSNARE1Q96NA8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSNARE1Q96NA8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSNARE1Q96NA8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSNARE1Q96NA8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSNARE1Q96NA8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSNARE1Q96NA8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSNARE1Q96NA8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSNARE1Q96NA8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSNARE1Q96NA8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSNARE1Q96NA8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSNARE1Q96NA8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSNARE1Q96NA8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSNARE1Q96NA8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSNARE1Q96NA8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TSNARE1Q96NA8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TSNARE1Q96NA8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSNARE1Q96NA8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TSNARE1Q96NA8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSNARE1Q96NA8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSNARE1Q96NA8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TSNARE1Q96NA8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TSNARE1Q96NA8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSNARE1Q96NA8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TSNARE1Q96NA8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSNARE1Q96NA8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSNARE1Q96NA8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSNARE1Q96NA8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSNARE1Q96NA8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSNARE1Q96NA8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSNARE1Q96NA8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSNARE1Q96NA8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSNARE1Q96NA8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSNARE1Q96NA8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSNARE1Q96NA8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSNARE1Q96NA8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSNARE1Q96NA8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSNARE1Q96NA8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSNARE1Q96NA8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TSNARE1Q96NA8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TSNARE1Q96NA8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSNARE1Q96NA8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSNARE1Q96NA8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSNARE1Q96NA8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSNARE1Q96NA8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSNARE1Q96NA8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSNARE1Q96NA8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSNARE1Q96NA8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSNARE1Q96NA8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSNARE1Q96NA8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSNARE1Q96NA8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSNARE1Q96NA8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSNARE1Q96NA8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TSNARE1Q96NA8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSNARE1Q96NA8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSNARE1Q96NA8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSNARE1Q96NA8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSNARE1Q96NA8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSNARE1Q96NA8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSNARE1Q96NA8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TSNARE1Q96NA8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSNARE1Q96NA8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSNARE1Q96NA8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSNARE1Q96NA8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSNARE1Q96NA8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSNARE1Q96NA8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSNARE1Q96NA8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TSNARE1Q96NA8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSNARE1Q96NA8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSNARE1Q96NA8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TSNARE1Q96NA8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSNARE1Q96NA8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSNARE1Q96NA8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSNARE1Q96NA8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSNARE1Q96NA8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSNARE1Q96NA8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSNARE1Q96NA8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSNARE1Q96NA8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSNARE1Q96NA8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSNARE1Q96NA8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSNARE1Q96NA8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSNARE1Q96NA8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSNARE1Q96NA8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSNARE1Q96NA8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSNARE1Q96NA8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSNARE1Q96NA8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSNARE1Q96NA8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSNARE1Q96NA8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSNARE1Q96NA8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSNARE1Q96NA8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSNARE1Q96NA8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSNARE1Q96NA8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSNARE1Q96NA8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TSNARE1Q96NA8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms