Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00167Q96N53 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00167Q96N53 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00167Q96N53 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00167Q96N53 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00167Q96N53 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00167Q96N53 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00167Q96N53 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00167Q96N53 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00167Q96N53 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00167Q96N53 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00167Q96N53 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00167Q96N53 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00167Q96N53 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00167Q96N53 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00167Q96N53 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00167Q96N53 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00167Q96N53 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00167Q96N53 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00167Q96N53 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00167Q96N53 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00167Q96N53 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00167Q96N53 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00167Q96N53 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00167Q96N53 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00167Q96N53 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00167Q96N53 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00167Q96N53 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00167Q96N53 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00167Q96N53 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00167Q96N53 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00167Q96N53 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00167Q96N53 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00167Q96N53 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00167Q96N53 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00167Q96N53 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00167Q96N53 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00167Q96N53 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00167Q96N53 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00167Q96N53 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00167Q96N53 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00167Q96N53 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00167Q96N53 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00167Q96N53 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00167Q96N53 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00167Q96N53 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00167Q96N53 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00167Q96N53 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00167Q96N53 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00167Q96N53 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00167Q96N53 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00167Q96N53 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00167Q96N53 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00167Q96N53 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00167Q96N53 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms