Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR3

MED30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED30Q96HR3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED30Q96HR3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED30Q96HR3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED30Q96HR3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED30Q96HR3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED30Q96HR3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MED30Q96HR3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED30Q96HR3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED30Q96HR3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED30Q96HR3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED30Q96HR3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED30Q96HR3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MED30Q96HR3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED30Q96HR3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED30Q96HR3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED30Q96HR3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED30Q96HR3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED30Q96HR3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED30Q96HR3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED30Q96HR3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED30Q96HR3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED30Q96HR3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED30Q96HR3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED30Q96HR3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED30Q96HR3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED30Q96HR3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED30Q96HR3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED30Q96HR3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED30Q96HR3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED30Q96HR3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MED30Q96HR3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED30Q96HR3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED30Q96HR3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED30Q96HR3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED30Q96HR3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED30Q96HR3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED30Q96HR3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED30Q96HR3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED30Q96HR3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED30Q96HR3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED30Q96HR3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MED30Q96HR3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MED30Q96HR3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED30Q96HR3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED30Q96HR3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED30Q96HR3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED30Q96HR3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED30Q96HR3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED30Q96HR3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED30Q96HR3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED30Q96HR3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED30Q96HR3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED30Q96HR3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED30Q96HR3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED30Q96HR3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED30Q96HR3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED30Q96HR3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED30Q96HR3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED30Q96HR3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MED30Q96HR3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED30Q96HR3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED30Q96HR3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED30Q96HR3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED30Q96HR3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED30Q96HR3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED30Q96HR3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms