Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF185Q96GF1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF185Q96GF1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF185Q96GF1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNF185Q96GF1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNF185Q96GF1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RNF185Q96GF1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNF185Q96GF1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNF185Q96GF1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNF185Q96GF1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RNF185Q96GF1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RNF185Q96GF1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RNF185Q96GF1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF185Q96GF1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF185Q96GF1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF185Q96GF1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RNF185Q96GF1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RNF185Q96GF1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNF185Q96GF1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RNF185Q96GF1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF185Q96GF1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNF185Q96GF1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF185Q96GF1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNF185Q96GF1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF185Q96GF1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF185Q96GF1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNF185Q96GF1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNF185Q96GF1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNF185Q96GF1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNF185Q96GF1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNF185Q96GF1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNF185Q96GF1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNF185Q96GF1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNF185Q96GF1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNF185Q96GF1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNF185Q96GF1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNF185Q96GF1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNF185Q96GF1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNF185Q96GF1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNF185Q96GF1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNF185Q96GF1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNF185Q96GF1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RNF185Q96GF1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RNF185Q96GF1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNF185Q96GF1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNF185Q96GF1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNF185Q96GF1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNF185Q96GF1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNF185Q96GF1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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