Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERP27Q96DN0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ERP27Q96DN0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERP27Q96DN0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERP27Q96DN0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERP27Q96DN0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERP27Q96DN0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERP27Q96DN0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERP27Q96DN0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERP27Q96DN0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERP27Q96DN0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERP27Q96DN0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERP27Q96DN0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERP27Q96DN0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERP27Q96DN0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERP27Q96DN0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERP27Q96DN0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERP27Q96DN0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERP27Q96DN0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERP27Q96DN0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERP27Q96DN0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ERP27Q96DN0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERP27Q96DN0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERP27Q96DN0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERP27Q96DN0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERP27Q96DN0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERP27Q96DN0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERP27Q96DN0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERP27Q96DN0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERP27Q96DN0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERP27Q96DN0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERP27Q96DN0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERP27Q96DN0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERP27Q96DN0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERP27Q96DN0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERP27Q96DN0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERP27Q96DN0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERP27Q96DN0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERP27Q96DN0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERP27Q96DN0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERP27Q96DN0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERP27Q96DN0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERP27Q96DN0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERP27Q96DN0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERP27Q96DN0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERP27Q96DN0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERP27Q96DN0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERP27Q96DN0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERP27Q96DN0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERP27Q96DN0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERP27Q96DN0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERP27Q96DN0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERP27Q96DN0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ERP27Q96DN0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERP27Q96DN0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERP27Q96DN0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERP27Q96DN0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERP27Q96DN0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERP27Q96DN0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERP27Q96DN0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERP27Q96DN0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERP27Q96DN0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERP27Q96DN0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERP27Q96DN0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ERP27Q96DN0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERP27Q96DN0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERP27Q96DN0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERP27Q96DN0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERP27Q96DN0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERP27Q96DN0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERP27Q96DN0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ERP27Q96DN0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERP27Q96DN0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ERP27Q96DN0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERP27Q96DN0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERP27Q96DN0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERP27Q96DN0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERP27Q96DN0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERP27Q96DN0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERP27Q96DN0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERP27Q96DN0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERP27Q96DN0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERP27Q96DN0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms