Protein–RNA interactions for Protein: Q969M7

UBE2F, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2FQ969M7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2FQ969M7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2FQ969M7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE2FQ969M7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBE2FQ969M7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
UBE2FQ969M7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2FQ969M7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2FQ969M7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2FQ969M7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2FQ969M7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2FQ969M7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2FQ969M7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2FQ969M7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2FQ969M7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2FQ969M7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2FQ969M7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2FQ969M7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2FQ969M7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2FQ969M7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE2FQ969M7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2FQ969M7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2FQ969M7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE2FQ969M7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE2FQ969M7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE2FQ969M7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE2FQ969M7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE2FQ969M7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2FQ969M7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2FQ969M7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2FQ969M7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2FQ969M7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE2FQ969M7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2FQ969M7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE2FQ969M7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE2FQ969M7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2FQ969M7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE2FQ969M7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2FQ969M7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE2FQ969M7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE2FQ969M7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2FQ969M7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2FQ969M7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2FQ969M7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2FQ969M7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE2FQ969M7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2FQ969M7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2FQ969M7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2FQ969M7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE2FQ969M7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2FQ969M7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE2FQ969M7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2FQ969M7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2FQ969M7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE2FQ969M7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2FQ969M7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE2FQ969M7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2FQ969M7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE2FQ969M7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2FQ969M7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2FQ969M7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2FQ969M7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2FQ969M7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2FQ969M7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2FQ969M7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2FQ969M7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2FQ969M7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2FQ969M7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2FQ969M7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2FQ969M7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2FQ969M7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2FQ969M7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2FQ969M7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2FQ969M7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE2FQ969M7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2FQ969M7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2FQ969M7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2FQ969M7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2FQ969M7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2FQ969M7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2FQ969M7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2FQ969M7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2FQ969M7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBE2FQ969M7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2FQ969M7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2FQ969M7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2FQ969M7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2FQ969M7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2FQ969M7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE2FQ969M7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2FQ969M7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2FQ969M7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2FQ969M7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2FQ969M7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE2FQ969M7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE2FQ969M7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE2FQ969M7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2FQ969M7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2FQ969M7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2FQ969M7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2FQ969M7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms