Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LHX4Q969G2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX4Q969G2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX4Q969G2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LHX4Q969G2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LHX4Q969G2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LHX4Q969G2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LHX4Q969G2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX4Q969G2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX4Q969G2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX4Q969G2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LHX4Q969G2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX4Q969G2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LHX4Q969G2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX4Q969G2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX4Q969G2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX4Q969G2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX4Q969G2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX4Q969G2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX4Q969G2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX4Q969G2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX4Q969G2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX4Q969G2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX4Q969G2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX4Q969G2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX4Q969G2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX4Q969G2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX4Q969G2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX4Q969G2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LHX4Q969G2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LHX4Q969G2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX4Q969G2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX4Q969G2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX4Q969G2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX4Q969G2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LHX4Q969G2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LHX4Q969G2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX4Q969G2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LHX4Q969G2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX4Q969G2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX4Q969G2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX4Q969G2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX4Q969G2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX4Q969G2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX4Q969G2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX4Q969G2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX4Q969G2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX4Q969G2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX4Q969G2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX4Q969G2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LHX4Q969G2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms