Protein–RNA interactions for Protein: Q92979

EMG1, Ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMG1Q92979 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMG1Q92979 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMG1Q92979 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMG1Q92979 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMG1Q92979 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMG1Q92979 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMG1Q92979 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EMG1Q92979 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMG1Q92979 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMG1Q92979 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMG1Q92979 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMG1Q92979 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMG1Q92979 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMG1Q92979 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMG1Q92979 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMG1Q92979 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMG1Q92979 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMG1Q92979 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EMG1Q92979 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMG1Q92979 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMG1Q92979 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMG1Q92979 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMG1Q92979 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMG1Q92979 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMG1Q92979 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMG1Q92979 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMG1Q92979 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMG1Q92979 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMG1Q92979 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMG1Q92979 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMG1Q92979 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMG1Q92979 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EMG1Q92979 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMG1Q92979 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMG1Q92979 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EMG1Q92979 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMG1Q92979 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMG1Q92979 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMG1Q92979 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMG1Q92979 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMG1Q92979 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMG1Q92979 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMG1Q92979 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMG1Q92979 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMG1Q92979 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMG1Q92979 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMG1Q92979 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMG1Q92979 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMG1Q92979 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMG1Q92979 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMG1Q92979 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMG1Q92979 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EMG1Q92979 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EMG1Q92979 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EMG1Q92979 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMG1Q92979 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMG1Q92979 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMG1Q92979 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMG1Q92979 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMG1Q92979 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMG1Q92979 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMG1Q92979 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMG1Q92979 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMG1Q92979 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EMG1Q92979 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EMG1Q92979 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMG1Q92979 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EMG1Q92979 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMG1Q92979 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMG1Q92979 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMG1Q92979 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMG1Q92979 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMG1Q92979 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMG1Q92979 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMG1Q92979 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMG1Q92979 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EMG1Q92979 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMG1Q92979 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMG1Q92979 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMG1Q92979 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMG1Q92979 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMG1Q92979 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMG1Q92979 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMG1Q92979 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMG1Q92979 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms