Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC48.39■■■■■ 5.34
TRIM41Q8WV44 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
TRIM41Q8WV44 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.34■■■■■ 5.33
TRIM41Q8WV44 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC48.34■■■■■ 5.33
TRIM41Q8WV44 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC48.34■■■■■ 5.33
TRIM41Q8WV44 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
TRIM41Q8WV44 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC48.3■■■■■ 5.32
TRIM41Q8WV44 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
TRIM41Q8WV44 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
TRIM41Q8WV44 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC48.26■■■■■ 5.32
TRIM41Q8WV44 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC48.18■■■■■ 5.3
TRIM41Q8WV44 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.18■■■■■ 5.3
TRIM41Q8WV44 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC48.18■■■■■ 5.3
TRIM41Q8WV44 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC48.16■■■■■ 5.3
TRIM41Q8WV44 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
TRIM41Q8WV44 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
TRIM41Q8WV44 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
TRIM41Q8WV44 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC48.11■■■■■ 5.29
TRIM41Q8WV44 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC48.11■■■■■ 5.29
TRIM41Q8WV44 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.09■■■■■ 5.29
TRIM41Q8WV44 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
TRIM41Q8WV44 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC48.07■■■■■ 5.29
TRIM41Q8WV44 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC48.06■■■■■ 5.28
TRIM41Q8WV44 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.06■■■■■ 5.28
TRIM41Q8WV44 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
TRIM41Q8WV44 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC48.04■■■■■ 5.28
TRIM41Q8WV44 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC48.04■■■■■ 5.28
TRIM41Q8WV44 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC48.04■■■■■ 5.28
TRIM41Q8WV44 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
TRIM41Q8WV44 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
TRIM41Q8WV44 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
TRIM41Q8WV44 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC47.91■■■■■ 5.26
TRIM41Q8WV44 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC47.91■■■■■ 5.26
TRIM41Q8WV44 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
TRIM41Q8WV44 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
TRIM41Q8WV44 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC47.88■■■■■ 5.26
TRIM41Q8WV44 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
TRIM41Q8WV44 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
TRIM41Q8WV44 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.84■■■■■ 5.25
TRIM41Q8WV44 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC47.81■■■■■ 5.24
TRIM41Q8WV44 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
TRIM41Q8WV44 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.78■■■■■ 5.24
TRIM41Q8WV44 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
TRIM41Q8WV44 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
TRIM41Q8WV44 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC47.7■■■■■ 5.23
TRIM41Q8WV44 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC47.69■■■■■ 5.22
TRIM41Q8WV44 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC47.67■■■■■ 5.22
TRIM41Q8WV44 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
TRIM41Q8WV44 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC47.65■■■■■ 5.22
TRIM41Q8WV44 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
TRIM41Q8WV44 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC47.63■■■■■ 5.22
TRIM41Q8WV44 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC47.62■■■■■ 5.21
TRIM41Q8WV44 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.61■■■■■ 5.21
TRIM41Q8WV44 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.61■■■■■ 5.21
TRIM41Q8WV44 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC47.56■■■■■ 5.2
TRIM41Q8WV44 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC47.54■■■■■ 5.2
TRIM41Q8WV44 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC47.53■■■■■ 5.2
TRIM41Q8WV44 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC47.52■■■■■ 5.2
TRIM41Q8WV44 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
TRIM41Q8WV44 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
TRIM41Q8WV44 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
TRIM41Q8WV44 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC47.48■■■■■ 5.19
TRIM41Q8WV44 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC47.48■■■■■ 5.19
TRIM41Q8WV44 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC47.47■■■■■ 5.19
TRIM41Q8WV44 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
TRIM41Q8WV44 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC47.46■■■■■ 5.19
TRIM41Q8WV44 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
TRIM41Q8WV44 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC47.45■■■■■ 5.19
TRIM41Q8WV44 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC47.45■■■■■ 5.19
TRIM41Q8WV44 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.43■■■■■ 5.18
TRIM41Q8WV44 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
TRIM41Q8WV44 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC47.42■■■■■ 5.18
TRIM41Q8WV44 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
TRIM41Q8WV44 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.41■■■■■ 5.18
TRIM41Q8WV44 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC47.41■■■■■ 5.18
TRIM41Q8WV44 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC47.41■■■■■ 5.18
TRIM41Q8WV44 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
TRIM41Q8WV44 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC47.36■■■■■ 5.17
TRIM41Q8WV44 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC47.35■■■■■ 5.17
TRIM41Q8WV44 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
TRIM41Q8WV44 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.34■■■■■ 5.17
TRIM41Q8WV44 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
TRIM41Q8WV44 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.32■■■■■ 5.17
TRIM41Q8WV44 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
TRIM41Q8WV44 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
TRIM41Q8WV44 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
TRIM41Q8WV44 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC47.29■■■■■ 5.16
TRIM41Q8WV44 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.29■■■■■ 5.16
TRIM41Q8WV44 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
TRIM41Q8WV44 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
TRIM41Q8WV44 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC47.22■■■■■ 5.15
TRIM41Q8WV44 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
TRIM41Q8WV44 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC47.2■■■■■ 5.15
TRIM41Q8WV44 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC47.2■■■■■ 5.15
TRIM41Q8WV44 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC47.18■■■■■ 5.14
TRIM41Q8WV44 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.17■■■■■ 5.14
TRIM41Q8WV44 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
TRIM41Q8WV44 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC47.13■■■■■ 5.14
TRIM41Q8WV44 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
TRIM41Q8WV44 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms