Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETD9Q8NE22 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETD9Q8NE22 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETD9Q8NE22 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD9Q8NE22 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD9Q8NE22 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD9Q8NE22 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETD9Q8NE22 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SETD9Q8NE22 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETD9Q8NE22 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD9Q8NE22 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETD9Q8NE22 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETD9Q8NE22 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETD9Q8NE22 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETD9Q8NE22 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETD9Q8NE22 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETD9Q8NE22 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SETD9Q8NE22 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETD9Q8NE22 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETD9Q8NE22 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETD9Q8NE22 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD9Q8NE22 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD9Q8NE22 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETD9Q8NE22 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD9Q8NE22 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETD9Q8NE22 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETD9Q8NE22 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD9Q8NE22 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD9Q8NE22 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETD9Q8NE22 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETD9Q8NE22 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETD9Q8NE22 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETD9Q8NE22 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD9Q8NE22 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD9Q8NE22 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETD9Q8NE22 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETD9Q8NE22 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETD9Q8NE22 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD9Q8NE22 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETD9Q8NE22 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD9Q8NE22 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD9Q8NE22 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD9Q8NE22 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD9Q8NE22 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD9Q8NE22 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD9Q8NE22 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD9Q8NE22 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD9Q8NE22 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD9Q8NE22 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD9Q8NE22 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD9Q8NE22 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD9Q8NE22 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD9Q8NE22 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD9Q8NE22 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD9Q8NE22 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD9Q8NE22 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD9Q8NE22 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SETD9Q8NE22 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD9Q8NE22 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD9Q8NE22 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD9Q8NE22 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SETD9Q8NE22 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETD9Q8NE22 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SETD9Q8NE22 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SETD9Q8NE22 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD9Q8NE22 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SETD9Q8NE22 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD9Q8NE22 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD9Q8NE22 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SETD9Q8NE22 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SETD9Q8NE22 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SETD9Q8NE22 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD9Q8NE22 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD9Q8NE22 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD9Q8NE22 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD9Q8NE22 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD9Q8NE22 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD9Q8NE22 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD9Q8NE22 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD9Q8NE22 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD9Q8NE22 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms