Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC63Q8NA47 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC63Q8NA47 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC63Q8NA47 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC63Q8NA47 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC63Q8NA47 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC63Q8NA47 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC63Q8NA47 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC63Q8NA47 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC63Q8NA47 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC63Q8NA47 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC63Q8NA47 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC63Q8NA47 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC63Q8NA47 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC63Q8NA47 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC63Q8NA47 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC63Q8NA47 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC63Q8NA47 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC63Q8NA47 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC63Q8NA47 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC63Q8NA47 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC63Q8NA47 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC63Q8NA47 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC63Q8NA47 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC63Q8NA47 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC63Q8NA47 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC63Q8NA47 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC63Q8NA47 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC63Q8NA47 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC63Q8NA47 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC63Q8NA47 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC63Q8NA47 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC63Q8NA47 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC63Q8NA47 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC63Q8NA47 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC63Q8NA47 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC63Q8NA47 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC63Q8NA47 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC63Q8NA47 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC63Q8NA47 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC63Q8NA47 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC63Q8NA47 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC63Q8NA47 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC63Q8NA47 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC63Q8NA47 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC63Q8NA47 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC63Q8NA47 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC63Q8NA47 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC63Q8NA47 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC63Q8NA47 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC63Q8NA47 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC63Q8NA47 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC63Q8NA47 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC63Q8NA47 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC63Q8NA47 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC63Q8NA47 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC63Q8NA47 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC63Q8NA47 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC63Q8NA47 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC63Q8NA47 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC63Q8NA47 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC63Q8NA47 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC63Q8NA47 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC63Q8NA47 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC63Q8NA47 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC63Q8NA47 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC63Q8NA47 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC63Q8NA47 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC63Q8NA47 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC63Q8NA47 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC63Q8NA47 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC63Q8NA47 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC63Q8NA47 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC63Q8NA47 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC63Q8NA47 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC63Q8NA47 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC63Q8NA47 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC63Q8NA47 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC63Q8NA47 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC63Q8NA47 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC63Q8NA47 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC63Q8NA47 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC63Q8NA47 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC63Q8NA47 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC63Q8NA47 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC63Q8NA47 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC63Q8NA47 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC63Q8NA47 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC63Q8NA47 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC63Q8NA47 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC63Q8NA47 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC63Q8NA47 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC63Q8NA47 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC63Q8NA47 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC63Q8NA47 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC63Q8NA47 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC63Q8NA47 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC63Q8NA47 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC63Q8NA47 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC63Q8NA47 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms