Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y46

KRT73, Keratin, type II cytoskeletal 73, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT73Q86Y46 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT73Q86Y46 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT73Q86Y46 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT73Q86Y46 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT73Q86Y46 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT73Q86Y46 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT73Q86Y46 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT73Q86Y46 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT73Q86Y46 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT73Q86Y46 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT73Q86Y46 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT73Q86Y46 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT73Q86Y46 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT73Q86Y46 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT73Q86Y46 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT73Q86Y46 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT73Q86Y46 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT73Q86Y46 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT73Q86Y46 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT73Q86Y46 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT73Q86Y46 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT73Q86Y46 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT73Q86Y46 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT73Q86Y46 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT73Q86Y46 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT73Q86Y46 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT73Q86Y46 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT73Q86Y46 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT73Q86Y46 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT73Q86Y46 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT73Q86Y46 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT73Q86Y46 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT73Q86Y46 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT73Q86Y46 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT73Q86Y46 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT73Q86Y46 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT73Q86Y46 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT73Q86Y46 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT73Q86Y46 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT73Q86Y46 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT73Q86Y46 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT73Q86Y46 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT73Q86Y46 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT73Q86Y46 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT73Q86Y46 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT73Q86Y46 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT73Q86Y46 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT73Q86Y46 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT73Q86Y46 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT73Q86Y46 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT73Q86Y46 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT73Q86Y46 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT73Q86Y46 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT73Q86Y46 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT73Q86Y46 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT73Q86Y46 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT73Q86Y46 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT73Q86Y46 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT73Q86Y46 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT73Q86Y46 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT73Q86Y46 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT73Q86Y46 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT73Q86Y46 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT73Q86Y46 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT73Q86Y46 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT73Q86Y46 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT73Q86Y46 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT73Q86Y46 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT73Q86Y46 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT73Q86Y46 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT73Q86Y46 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT73Q86Y46 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT73Q86Y46 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT73Q86Y46 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT73Q86Y46 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT73Q86Y46 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT73Q86Y46 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT73Q86Y46 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT73Q86Y46 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT73Q86Y46 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT73Q86Y46 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT73Q86Y46 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT73Q86Y46 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT73Q86Y46 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT73Q86Y46 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT73Q86Y46 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT73Q86Y46 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT73Q86Y46 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT73Q86Y46 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT73Q86Y46 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT73Q86Y46 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT73Q86Y46 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT73Q86Y46 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT73Q86Y46 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT73Q86Y46 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT73Q86Y46 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT73Q86Y46 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT73Q86Y46 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT73Q86Y46 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT73Q86Y46 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms