Protein–RNA interactions for Protein: Q86TD4

SRL, Sarcalumenin, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRLQ86TD4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SRLQ86TD4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRLQ86TD4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRLQ86TD4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRLQ86TD4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRLQ86TD4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRLQ86TD4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRLQ86TD4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRLQ86TD4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRLQ86TD4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SRLQ86TD4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRLQ86TD4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRLQ86TD4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRLQ86TD4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRLQ86TD4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRLQ86TD4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRLQ86TD4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRLQ86TD4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SRLQ86TD4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRLQ86TD4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRLQ86TD4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRLQ86TD4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRLQ86TD4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRLQ86TD4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRLQ86TD4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRLQ86TD4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRLQ86TD4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRLQ86TD4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRLQ86TD4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRLQ86TD4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SRLQ86TD4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRLQ86TD4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRLQ86TD4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRLQ86TD4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRLQ86TD4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRLQ86TD4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRLQ86TD4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRLQ86TD4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRLQ86TD4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRLQ86TD4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRLQ86TD4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRLQ86TD4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRLQ86TD4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRLQ86TD4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRLQ86TD4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRLQ86TD4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRLQ86TD4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRLQ86TD4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRLQ86TD4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRLQ86TD4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRLQ86TD4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRLQ86TD4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRLQ86TD4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRLQ86TD4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRLQ86TD4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRLQ86TD4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRLQ86TD4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRLQ86TD4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRLQ86TD4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRLQ86TD4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRLQ86TD4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRLQ86TD4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRLQ86TD4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRLQ86TD4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRLQ86TD4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRLQ86TD4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRLQ86TD4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRLQ86TD4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRLQ86TD4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRLQ86TD4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRLQ86TD4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRLQ86TD4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRLQ86TD4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRLQ86TD4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRLQ86TD4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRLQ86TD4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRLQ86TD4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRLQ86TD4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRLQ86TD4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRLQ86TD4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRLQ86TD4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SRLQ86TD4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRLQ86TD4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SRLQ86TD4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRLQ86TD4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRLQ86TD4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRLQ86TD4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRLQ86TD4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRLQ86TD4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRLQ86TD4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRLQ86TD4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRLQ86TD4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRLQ86TD4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRLQ86TD4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRLQ86TD4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SRLQ86TD4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRLQ86TD4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRLQ86TD4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRLQ86TD4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRLQ86TD4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms