Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSX7Q7RTT5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSX7Q7RTT5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX7Q7RTT5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX7Q7RTT5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSX7Q7RTT5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX7Q7RTT5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX7Q7RTT5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX7Q7RTT5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX7Q7RTT5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSX7Q7RTT5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSX7Q7RTT5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX7Q7RTT5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX7Q7RTT5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX7Q7RTT5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX7Q7RTT5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX7Q7RTT5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX7Q7RTT5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX7Q7RTT5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX7Q7RTT5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX7Q7RTT5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX7Q7RTT5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSX7Q7RTT5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX7Q7RTT5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX7Q7RTT5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSX7Q7RTT5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSX7Q7RTT5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSX7Q7RTT5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSX7Q7RTT5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSX7Q7RTT5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SSX7Q7RTT5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SSX7Q7RTT5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SSX7Q7RTT5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSX7Q7RTT5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX7Q7RTT5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX7Q7RTT5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX7Q7RTT5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX7Q7RTT5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX7Q7RTT5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms