Protein–RNA interactions for Protein: Q76KD6

SPATC1, Speriolin, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATC1Q76KD6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPATC1Q76KD6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPATC1Q76KD6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPATC1Q76KD6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATC1Q76KD6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATC1Q76KD6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATC1Q76KD6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATC1Q76KD6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATC1Q76KD6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPATC1Q76KD6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPATC1Q76KD6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPATC1Q76KD6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPATC1Q76KD6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPATC1Q76KD6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPATC1Q76KD6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATC1Q76KD6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPATC1Q76KD6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATC1Q76KD6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPATC1Q76KD6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATC1Q76KD6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPATC1Q76KD6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPATC1Q76KD6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATC1Q76KD6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATC1Q76KD6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPATC1Q76KD6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPATC1Q76KD6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPATC1Q76KD6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATC1Q76KD6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATC1Q76KD6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPATC1Q76KD6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATC1Q76KD6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPATC1Q76KD6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPATC1Q76KD6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPATC1Q76KD6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPATC1Q76KD6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPATC1Q76KD6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATC1Q76KD6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPATC1Q76KD6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATC1Q76KD6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATC1Q76KD6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATC1Q76KD6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPATC1Q76KD6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATC1Q76KD6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPATC1Q76KD6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPATC1Q76KD6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATC1Q76KD6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATC1Q76KD6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPATC1Q76KD6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPATC1Q76KD6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATC1Q76KD6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATC1Q76KD6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPATC1Q76KD6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATC1Q76KD6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATC1Q76KD6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPATC1Q76KD6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATC1Q76KD6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATC1Q76KD6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATC1Q76KD6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPATC1Q76KD6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPATC1Q76KD6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATC1Q76KD6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATC1Q76KD6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPATC1Q76KD6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPATC1Q76KD6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATC1Q76KD6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATC1Q76KD6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATC1Q76KD6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATC1Q76KD6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATC1Q76KD6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATC1Q76KD6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATC1Q76KD6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATC1Q76KD6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATC1Q76KD6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATC1Q76KD6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATC1Q76KD6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATC1Q76KD6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATC1Q76KD6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATC1Q76KD6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATC1Q76KD6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATC1Q76KD6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATC1Q76KD6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATC1Q76KD6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATC1Q76KD6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATC1Q76KD6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATC1Q76KD6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms