Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM47EQ6ZV65 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM47EQ6ZV65 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM47EQ6ZV65 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM47EQ6ZV65 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM47EQ6ZV65 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM47EQ6ZV65 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM47EQ6ZV65 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM47EQ6ZV65 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM47EQ6ZV65 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM47EQ6ZV65 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM47EQ6ZV65 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM47EQ6ZV65 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM47EQ6ZV65 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM47EQ6ZV65 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM47EQ6ZV65 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM47EQ6ZV65 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM47EQ6ZV65 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM47EQ6ZV65 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM47EQ6ZV65 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM47EQ6ZV65 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM47EQ6ZV65 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM47EQ6ZV65 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM47EQ6ZV65 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM47EQ6ZV65 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM47EQ6ZV65 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM47EQ6ZV65 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM47EQ6ZV65 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM47EQ6ZV65 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM47EQ6ZV65 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47EQ6ZV65 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47EQ6ZV65 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM47EQ6ZV65 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM47EQ6ZV65 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FAM47EQ6ZV65 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM47EQ6ZV65 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FAM47EQ6ZV65 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FAM47EQ6ZV65 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FAM47EQ6ZV65 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM47EQ6ZV65 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM47EQ6ZV65 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM47EQ6ZV65 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM47EQ6ZV65 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FAM47EQ6ZV65 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM47EQ6ZV65 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM47EQ6ZV65 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM47EQ6ZV65 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM47EQ6ZV65 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM47EQ6ZV65 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FAM47EQ6ZV65 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM47EQ6ZV65 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM47EQ6ZV65 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FAM47EQ6ZV65 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM47EQ6ZV65 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM47EQ6ZV65 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM47EQ6ZV65 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM47EQ6ZV65 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM47EQ6ZV65 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM47EQ6ZV65 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM47EQ6ZV65 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM47EQ6ZV65 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM47EQ6ZV65 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47EQ6ZV65 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM47EQ6ZV65 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FAM47EQ6ZV65 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM47EQ6ZV65 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47EQ6ZV65 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM47EQ6ZV65 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM47EQ6ZV65 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM47EQ6ZV65 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM47EQ6ZV65 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM47EQ6ZV65 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM47EQ6ZV65 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
FAM47EQ6ZV65 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM47EQ6ZV65 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM47EQ6ZV65 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM47EQ6ZV65 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM47EQ6ZV65 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM47EQ6ZV65 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM47EQ6ZV65 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM47EQ6ZV65 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM47EQ6ZV65 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM47EQ6ZV65 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM47EQ6ZV65 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM47EQ6ZV65 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM47EQ6ZV65 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM47EQ6ZV65 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM47EQ6ZV65 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM47EQ6ZV65 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM47EQ6ZV65 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM47EQ6ZV65 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM47EQ6ZV65 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM47EQ6ZV65 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM47EQ6ZV65 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM47EQ6ZV65 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM47EQ6ZV65 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM47EQ6ZV65 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM47EQ6ZV65 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM47EQ6ZV65 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM47EQ6ZV65 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms