Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF493Q6ZR52 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF493Q6ZR52 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF493Q6ZR52 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF493Q6ZR52 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF493Q6ZR52 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNF493Q6ZR52 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF493Q6ZR52 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF493Q6ZR52 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF493Q6ZR52 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF493Q6ZR52 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF493Q6ZR52 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF493Q6ZR52 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF493Q6ZR52 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF493Q6ZR52 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF493Q6ZR52 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF493Q6ZR52 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF493Q6ZR52 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF493Q6ZR52 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF493Q6ZR52 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF493Q6ZR52 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF493Q6ZR52 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF493Q6ZR52 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF493Q6ZR52 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF493Q6ZR52 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF493Q6ZR52 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF493Q6ZR52 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF493Q6ZR52 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF493Q6ZR52 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF493Q6ZR52 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF493Q6ZR52 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF493Q6ZR52 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF493Q6ZR52 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF493Q6ZR52 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF493Q6ZR52 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF493Q6ZR52 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF493Q6ZR52 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF493Q6ZR52 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF493Q6ZR52 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF493Q6ZR52 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF493Q6ZR52 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF493Q6ZR52 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF493Q6ZR52 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF493Q6ZR52 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF493Q6ZR52 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF493Q6ZR52 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF493Q6ZR52 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF493Q6ZR52 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF493Q6ZR52 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF493Q6ZR52 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF493Q6ZR52 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF493Q6ZR52 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF493Q6ZR52 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF493Q6ZR52 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF493Q6ZR52 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms