Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASC2Q6XLA1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASC2Q6XLA1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASC2Q6XLA1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASC2Q6XLA1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASC2Q6XLA1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASC2Q6XLA1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASC2Q6XLA1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASC2Q6XLA1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASC2Q6XLA1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CASC2Q6XLA1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASC2Q6XLA1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASC2Q6XLA1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASC2Q6XLA1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CASC2Q6XLA1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CASC2Q6XLA1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CASC2Q6XLA1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASC2Q6XLA1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASC2Q6XLA1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASC2Q6XLA1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASC2Q6XLA1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASC2Q6XLA1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASC2Q6XLA1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASC2Q6XLA1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASC2Q6XLA1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASC2Q6XLA1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASC2Q6XLA1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASC2Q6XLA1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASC2Q6XLA1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASC2Q6XLA1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASC2Q6XLA1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASC2Q6XLA1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CASC2Q6XLA1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CASC2Q6XLA1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASC2Q6XLA1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASC2Q6XLA1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASC2Q6XLA1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASC2Q6XLA1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASC2Q6XLA1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASC2Q6XLA1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASC2Q6XLA1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASC2Q6XLA1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASC2Q6XLA1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASC2Q6XLA1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASC2Q6XLA1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASC2Q6XLA1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASC2Q6XLA1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASC2Q6XLA1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CASC2Q6XLA1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASC2Q6XLA1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASC2Q6XLA1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CASC2Q6XLA1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASC2Q6XLA1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASC2Q6XLA1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASC2Q6XLA1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASC2Q6XLA1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASC2Q6XLA1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASC2Q6XLA1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASC2Q6XLA1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CASC2Q6XLA1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms