Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MUC6Q6W4X9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MUC6Q6W4X9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MUC6Q6W4X9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MUC6Q6W4X9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MUC6Q6W4X9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MUC6Q6W4X9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MUC6Q6W4X9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MUC6Q6W4X9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MUC6Q6W4X9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MUC6Q6W4X9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MUC6Q6W4X9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MUC6Q6W4X9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MUC6Q6W4X9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MUC6Q6W4X9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MUC6Q6W4X9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MUC6Q6W4X9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MUC6Q6W4X9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MUC6Q6W4X9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MUC6Q6W4X9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MUC6Q6W4X9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MUC6Q6W4X9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MUC6Q6W4X9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MUC6Q6W4X9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MUC6Q6W4X9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MUC6Q6W4X9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MUC6Q6W4X9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MUC6Q6W4X9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MUC6Q6W4X9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MUC6Q6W4X9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MUC6Q6W4X9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MUC6Q6W4X9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MUC6Q6W4X9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MUC6Q6W4X9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MUC6Q6W4X9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MUC6Q6W4X9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MUC6Q6W4X9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MUC6Q6W4X9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MUC6Q6W4X9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MUC6Q6W4X9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MUC6Q6W4X9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MUC6Q6W4X9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MUC6Q6W4X9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MUC6Q6W4X9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MUC6Q6W4X9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MUC6Q6W4X9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MUC6Q6W4X9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MUC6Q6W4X9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MUC6Q6W4X9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MUC6Q6W4X9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MUC6Q6W4X9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MUC6Q6W4X9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MUC6Q6W4X9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MUC6Q6W4X9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MUC6Q6W4X9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MUC6Q6W4X9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MUC6Q6W4X9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MUC6Q6W4X9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MUC6Q6W4X9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MUC6Q6W4X9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MUC6Q6W4X9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MUC6Q6W4X9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MUC6Q6W4X9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MUC6Q6W4X9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MUC6Q6W4X9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MUC6Q6W4X9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MUC6Q6W4X9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MUC6Q6W4X9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MUC6Q6W4X9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MUC6Q6W4X9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MUC6Q6W4X9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MUC6Q6W4X9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MUC6Q6W4X9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MUC6Q6W4X9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MUC6Q6W4X9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MUC6Q6W4X9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MUC6Q6W4X9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MUC6Q6W4X9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MUC6Q6W4X9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MUC6Q6W4X9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MUC6Q6W4X9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MUC6Q6W4X9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MUC6Q6W4X9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MUC6Q6W4X9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MUC6Q6W4X9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MUC6Q6W4X9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MUC6Q6W4X9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MUC6Q6W4X9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MUC6Q6W4X9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MUC6Q6W4X9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MUC6Q6W4X9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MUC6Q6W4X9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MUC6Q6W4X9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MUC6Q6W4X9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MUC6Q6W4X9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MUC6Q6W4X9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MUC6Q6W4X9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MUC6Q6W4X9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MUC6Q6W4X9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MUC6Q6W4X9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms