Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRAIDQ6UW56 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRAIDQ6UW56 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRAIDQ6UW56 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRAIDQ6UW56 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRAIDQ6UW56 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRAIDQ6UW56 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRAIDQ6UW56 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRAIDQ6UW56 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRAIDQ6UW56 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRAIDQ6UW56 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRAIDQ6UW56 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRAIDQ6UW56 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRAIDQ6UW56 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRAIDQ6UW56 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRAIDQ6UW56 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRAIDQ6UW56 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRAIDQ6UW56 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRAIDQ6UW56 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRAIDQ6UW56 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRAIDQ6UW56 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRAIDQ6UW56 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRAIDQ6UW56 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATRAIDQ6UW56 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATRAIDQ6UW56 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATRAIDQ6UW56 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRAIDQ6UW56 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATRAIDQ6UW56 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRAIDQ6UW56 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATRAIDQ6UW56 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATRAIDQ6UW56 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATRAIDQ6UW56 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRAIDQ6UW56 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATRAIDQ6UW56 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRAIDQ6UW56 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRAIDQ6UW56 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRAIDQ6UW56 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATRAIDQ6UW56 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATRAIDQ6UW56 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRAIDQ6UW56 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRAIDQ6UW56 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATRAIDQ6UW56 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATRAIDQ6UW56 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATRAIDQ6UW56 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATRAIDQ6UW56 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRAIDQ6UW56 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRAIDQ6UW56 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRAIDQ6UW56 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATRAIDQ6UW56 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRAIDQ6UW56 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRAIDQ6UW56 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRAIDQ6UW56 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRAIDQ6UW56 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRAIDQ6UW56 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRAIDQ6UW56 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRAIDQ6UW56 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRAIDQ6UW56 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRAIDQ6UW56 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRAIDQ6UW56 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRAIDQ6UW56 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATRAIDQ6UW56 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRAIDQ6UW56 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATRAIDQ6UW56 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATRAIDQ6UW56 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATRAIDQ6UW56 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRAIDQ6UW56 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRAIDQ6UW56 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRAIDQ6UW56 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRAIDQ6UW56 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRAIDQ6UW56 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRAIDQ6UW56 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRAIDQ6UW56 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRAIDQ6UW56 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRAIDQ6UW56 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRAIDQ6UW56 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRAIDQ6UW56 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRAIDQ6UW56 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATRAIDQ6UW56 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRAIDQ6UW56 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATRAIDQ6UW56 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATRAIDQ6UW56 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRAIDQ6UW56 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRAIDQ6UW56 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRAIDQ6UW56 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRAIDQ6UW56 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATRAIDQ6UW56 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATRAIDQ6UW56 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRAIDQ6UW56 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRAIDQ6UW56 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRAIDQ6UW56 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATRAIDQ6UW56 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRAIDQ6UW56 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRAIDQ6UW56 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRAIDQ6UW56 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRAIDQ6UW56 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATRAIDQ6UW56 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATRAIDQ6UW56 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRAIDQ6UW56 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRAIDQ6UW56 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATRAIDQ6UW56 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms