Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SARM1Q6SZW1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SARM1Q6SZW1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SARM1Q6SZW1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SARM1Q6SZW1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SARM1Q6SZW1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SARM1Q6SZW1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SARM1Q6SZW1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SARM1Q6SZW1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SARM1Q6SZW1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SARM1Q6SZW1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SARM1Q6SZW1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SARM1Q6SZW1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SARM1Q6SZW1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SARM1Q6SZW1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SARM1Q6SZW1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SARM1Q6SZW1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SARM1Q6SZW1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SARM1Q6SZW1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SARM1Q6SZW1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SARM1Q6SZW1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SARM1Q6SZW1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SARM1Q6SZW1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SARM1Q6SZW1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SARM1Q6SZW1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SARM1Q6SZW1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SARM1Q6SZW1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SARM1Q6SZW1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SARM1Q6SZW1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SARM1Q6SZW1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SARM1Q6SZW1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SARM1Q6SZW1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SARM1Q6SZW1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SARM1Q6SZW1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SARM1Q6SZW1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SARM1Q6SZW1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SARM1Q6SZW1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SARM1Q6SZW1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SARM1Q6SZW1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SARM1Q6SZW1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SARM1Q6SZW1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SARM1Q6SZW1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SARM1Q6SZW1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SARM1Q6SZW1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SARM1Q6SZW1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SARM1Q6SZW1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SARM1Q6SZW1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SARM1Q6SZW1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SARM1Q6SZW1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SARM1Q6SZW1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SARM1Q6SZW1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SARM1Q6SZW1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SARM1Q6SZW1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SARM1Q6SZW1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SARM1Q6SZW1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SARM1Q6SZW1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SARM1Q6SZW1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SARM1Q6SZW1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SARM1Q6SZW1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SARM1Q6SZW1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SARM1Q6SZW1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SARM1Q6SZW1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SARM1Q6SZW1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SARM1Q6SZW1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SARM1Q6SZW1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SARM1Q6SZW1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SARM1Q6SZW1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SARM1Q6SZW1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SARM1Q6SZW1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SARM1Q6SZW1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SARM1Q6SZW1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SARM1Q6SZW1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SARM1Q6SZW1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SARM1Q6SZW1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SARM1Q6SZW1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SARM1Q6SZW1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SARM1Q6SZW1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SARM1Q6SZW1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SARM1Q6SZW1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SARM1Q6SZW1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SARM1Q6SZW1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SARM1Q6SZW1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SARM1Q6SZW1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SARM1Q6SZW1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SARM1Q6SZW1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SARM1Q6SZW1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SARM1Q6SZW1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SARM1Q6SZW1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SARM1Q6SZW1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SARM1Q6SZW1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SARM1Q6SZW1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SARM1Q6SZW1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SARM1Q6SZW1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SARM1Q6SZW1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SARM1Q6SZW1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SARM1Q6SZW1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SARM1Q6SZW1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SARM1Q6SZW1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SARM1Q6SZW1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SARM1Q6SZW1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms