Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFXN4Q6P4A7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFXN4Q6P4A7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFXN4Q6P4A7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFXN4Q6P4A7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SFXN4Q6P4A7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFXN4Q6P4A7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFXN4Q6P4A7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFXN4Q6P4A7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFXN4Q6P4A7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFXN4Q6P4A7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFXN4Q6P4A7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFXN4Q6P4A7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFXN4Q6P4A7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFXN4Q6P4A7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFXN4Q6P4A7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFXN4Q6P4A7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFXN4Q6P4A7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFXN4Q6P4A7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFXN4Q6P4A7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFXN4Q6P4A7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFXN4Q6P4A7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFXN4Q6P4A7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFXN4Q6P4A7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFXN4Q6P4A7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFXN4Q6P4A7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFXN4Q6P4A7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SFXN4Q6P4A7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFXN4Q6P4A7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFXN4Q6P4A7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFXN4Q6P4A7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFXN4Q6P4A7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFXN4Q6P4A7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFXN4Q6P4A7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFXN4Q6P4A7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFXN4Q6P4A7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFXN4Q6P4A7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFXN4Q6P4A7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFXN4Q6P4A7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFXN4Q6P4A7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFXN4Q6P4A7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFXN4Q6P4A7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFXN4Q6P4A7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFXN4Q6P4A7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFXN4Q6P4A7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFXN4Q6P4A7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFXN4Q6P4A7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SFXN4Q6P4A7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFXN4Q6P4A7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFXN4Q6P4A7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFXN4Q6P4A7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFXN4Q6P4A7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFXN4Q6P4A7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFXN4Q6P4A7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFXN4Q6P4A7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFXN4Q6P4A7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFXN4Q6P4A7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFXN4Q6P4A7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFXN4Q6P4A7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFXN4Q6P4A7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFXN4Q6P4A7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFXN4Q6P4A7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFXN4Q6P4A7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFXN4Q6P4A7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFXN4Q6P4A7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFXN4Q6P4A7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SFXN4Q6P4A7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFXN4Q6P4A7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFXN4Q6P4A7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFXN4Q6P4A7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFXN4Q6P4A7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFXN4Q6P4A7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SFXN4Q6P4A7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFXN4Q6P4A7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFXN4Q6P4A7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFXN4Q6P4A7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFXN4Q6P4A7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFXN4Q6P4A7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SFXN4Q6P4A7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFXN4Q6P4A7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFXN4Q6P4A7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFXN4Q6P4A7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFXN4Q6P4A7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFXN4Q6P4A7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFXN4Q6P4A7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFXN4Q6P4A7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFXN4Q6P4A7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFXN4Q6P4A7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFXN4Q6P4A7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SFXN4Q6P4A7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFXN4Q6P4A7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFXN4Q6P4A7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFXN4Q6P4A7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFXN4Q6P4A7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFXN4Q6P4A7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFXN4Q6P4A7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFXN4Q6P4A7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFXN4Q6P4A7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFXN4Q6P4A7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFXN4Q6P4A7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms