Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1L6

ZNF343, Zinc finger protein 343, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF343Q6P1L6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF343Q6P1L6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF343Q6P1L6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF343Q6P1L6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF343Q6P1L6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF343Q6P1L6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF343Q6P1L6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF343Q6P1L6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF343Q6P1L6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF343Q6P1L6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF343Q6P1L6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF343Q6P1L6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF343Q6P1L6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF343Q6P1L6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF343Q6P1L6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF343Q6P1L6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF343Q6P1L6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF343Q6P1L6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF343Q6P1L6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF343Q6P1L6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF343Q6P1L6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF343Q6P1L6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF343Q6P1L6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF343Q6P1L6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF343Q6P1L6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF343Q6P1L6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF343Q6P1L6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF343Q6P1L6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF343Q6P1L6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF343Q6P1L6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF343Q6P1L6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF343Q6P1L6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF343Q6P1L6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF343Q6P1L6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF343Q6P1L6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF343Q6P1L6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF343Q6P1L6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF343Q6P1L6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF343Q6P1L6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF343Q6P1L6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF343Q6P1L6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF343Q6P1L6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF343Q6P1L6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF343Q6P1L6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF343Q6P1L6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF343Q6P1L6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF343Q6P1L6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF343Q6P1L6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF343Q6P1L6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF343Q6P1L6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF343Q6P1L6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF343Q6P1L6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF343Q6P1L6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF343Q6P1L6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF343Q6P1L6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF343Q6P1L6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF343Q6P1L6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF343Q6P1L6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF343Q6P1L6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF343Q6P1L6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF343Q6P1L6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF343Q6P1L6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF343Q6P1L6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF343Q6P1L6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF343Q6P1L6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF343Q6P1L6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms