Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFRP4Q6FHJ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFRP4Q6FHJ7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFRP4Q6FHJ7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFRP4Q6FHJ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFRP4Q6FHJ7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFRP4Q6FHJ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFRP4Q6FHJ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFRP4Q6FHJ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFRP4Q6FHJ7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SFRP4Q6FHJ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFRP4Q6FHJ7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFRP4Q6FHJ7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFRP4Q6FHJ7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFRP4Q6FHJ7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFRP4Q6FHJ7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFRP4Q6FHJ7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFRP4Q6FHJ7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFRP4Q6FHJ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFRP4Q6FHJ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFRP4Q6FHJ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFRP4Q6FHJ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFRP4Q6FHJ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFRP4Q6FHJ7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFRP4Q6FHJ7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFRP4Q6FHJ7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFRP4Q6FHJ7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFRP4Q6FHJ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFRP4Q6FHJ7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFRP4Q6FHJ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFRP4Q6FHJ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFRP4Q6FHJ7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFRP4Q6FHJ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFRP4Q6FHJ7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFRP4Q6FHJ7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFRP4Q6FHJ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFRP4Q6FHJ7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFRP4Q6FHJ7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFRP4Q6FHJ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SFRP4Q6FHJ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFRP4Q6FHJ7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFRP4Q6FHJ7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFRP4Q6FHJ7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SFRP4Q6FHJ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFRP4Q6FHJ7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFRP4Q6FHJ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFRP4Q6FHJ7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.2 ms