Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0I6

KDM4D, Lysine-specific demethylase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4DQ6B0I6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM4DQ6B0I6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM4DQ6B0I6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM4DQ6B0I6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM4DQ6B0I6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM4DQ6B0I6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM4DQ6B0I6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4DQ6B0I6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4DQ6B0I6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4DQ6B0I6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4DQ6B0I6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4DQ6B0I6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4DQ6B0I6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM4DQ6B0I6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM4DQ6B0I6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM4DQ6B0I6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM4DQ6B0I6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM4DQ6B0I6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM4DQ6B0I6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM4DQ6B0I6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM4DQ6B0I6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4DQ6B0I6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM4DQ6B0I6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM4DQ6B0I6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4DQ6B0I6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4DQ6B0I6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4DQ6B0I6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4DQ6B0I6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4DQ6B0I6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4DQ6B0I6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4DQ6B0I6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4DQ6B0I6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM4DQ6B0I6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM4DQ6B0I6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM4DQ6B0I6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4DQ6B0I6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4DQ6B0I6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
KDM4DQ6B0I6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4DQ6B0I6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4DQ6B0I6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4DQ6B0I6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4DQ6B0I6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4DQ6B0I6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM4DQ6B0I6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM4DQ6B0I6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM4DQ6B0I6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4DQ6B0I6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4DQ6B0I6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM4DQ6B0I6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM4DQ6B0I6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4DQ6B0I6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM4DQ6B0I6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4DQ6B0I6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4DQ6B0I6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM4DQ6B0I6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4DQ6B0I6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4DQ6B0I6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM4DQ6B0I6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM4DQ6B0I6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4DQ6B0I6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4DQ6B0I6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM4DQ6B0I6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM4DQ6B0I6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4DQ6B0I6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4DQ6B0I6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4DQ6B0I6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM4DQ6B0I6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM4DQ6B0I6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4DQ6B0I6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4DQ6B0I6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4DQ6B0I6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4DQ6B0I6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM4DQ6B0I6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM4DQ6B0I6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4DQ6B0I6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4DQ6B0I6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4DQ6B0I6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4DQ6B0I6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4DQ6B0I6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4DQ6B0I6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4DQ6B0I6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4DQ6B0I6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM4DQ6B0I6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM4DQ6B0I6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM4DQ6B0I6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM4DQ6B0I6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4DQ6B0I6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4DQ6B0I6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4DQ6B0I6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4DQ6B0I6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4DQ6B0I6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4DQ6B0I6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM4DQ6B0I6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4DQ6B0I6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4DQ6B0I6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4DQ6B0I6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4DQ6B0I6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4DQ6B0I6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM4DQ6B0I6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM4DQ6B0I6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms