Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCARA3Q6AZY7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCARA3Q6AZY7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCARA3Q6AZY7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCARA3Q6AZY7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCARA3Q6AZY7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCARA3Q6AZY7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCARA3Q6AZY7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCARA3Q6AZY7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCARA3Q6AZY7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCARA3Q6AZY7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCARA3Q6AZY7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCARA3Q6AZY7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SCARA3Q6AZY7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCARA3Q6AZY7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCARA3Q6AZY7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCARA3Q6AZY7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCARA3Q6AZY7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCARA3Q6AZY7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCARA3Q6AZY7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCARA3Q6AZY7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCARA3Q6AZY7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCARA3Q6AZY7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCARA3Q6AZY7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCARA3Q6AZY7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCARA3Q6AZY7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCARA3Q6AZY7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SCARA3Q6AZY7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCARA3Q6AZY7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCARA3Q6AZY7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms