Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM236Q5W0B7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM236Q5W0B7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM236Q5W0B7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM236Q5W0B7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM236Q5W0B7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM236Q5W0B7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM236Q5W0B7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM236Q5W0B7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM236Q5W0B7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM236Q5W0B7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM236Q5W0B7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM236Q5W0B7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM236Q5W0B7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM236Q5W0B7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM236Q5W0B7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM236Q5W0B7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM236Q5W0B7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM236Q5W0B7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM236Q5W0B7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM236Q5W0B7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM236Q5W0B7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM236Q5W0B7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM236Q5W0B7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM236Q5W0B7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM236Q5W0B7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM236Q5W0B7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM236Q5W0B7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM236Q5W0B7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM236Q5W0B7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM236Q5W0B7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM236Q5W0B7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM236Q5W0B7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM236Q5W0B7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM236Q5W0B7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM236Q5W0B7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM236Q5W0B7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM236Q5W0B7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM236Q5W0B7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM236Q5W0B7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM236Q5W0B7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM236Q5W0B7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM236Q5W0B7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM236Q5W0B7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM236Q5W0B7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM236Q5W0B7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM236Q5W0B7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM236Q5W0B7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM236Q5W0B7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM236Q5W0B7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM236Q5W0B7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM236Q5W0B7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM236Q5W0B7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM236Q5W0B7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM236Q5W0B7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM236Q5W0B7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM236Q5W0B7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM236Q5W0B7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM236Q5W0B7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM236Q5W0B7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM236Q5W0B7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM236Q5W0B7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM236Q5W0B7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM236Q5W0B7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM236Q5W0B7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM236Q5W0B7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM236Q5W0B7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM236Q5W0B7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM236Q5W0B7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM236Q5W0B7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM236Q5W0B7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM236Q5W0B7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM236Q5W0B7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM236Q5W0B7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM236Q5W0B7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM236Q5W0B7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM236Q5W0B7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM236Q5W0B7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM236Q5W0B7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM236Q5W0B7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM236Q5W0B7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM236Q5W0B7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM236Q5W0B7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM236Q5W0B7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM236Q5W0B7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms