Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA31

RNF187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF187Q5TA31 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF187Q5TA31 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RNF187Q5TA31 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RNF187Q5TA31 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNF187Q5TA31 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF187Q5TA31 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF187Q5TA31 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF187Q5TA31 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF187Q5TA31 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF187Q5TA31 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF187Q5TA31 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF187Q5TA31 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF187Q5TA31 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF187Q5TA31 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF187Q5TA31 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF187Q5TA31 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNF187Q5TA31 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF187Q5TA31 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RNF187Q5TA31 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNF187Q5TA31 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF187Q5TA31 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF187Q5TA31 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF187Q5TA31 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF187Q5TA31 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF187Q5TA31 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF187Q5TA31 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF187Q5TA31 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RNF187Q5TA31 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF187Q5TA31 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF187Q5TA31 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF187Q5TA31 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF187Q5TA31 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF187Q5TA31 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF187Q5TA31 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF187Q5TA31 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF187Q5TA31 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF187Q5TA31 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF187Q5TA31 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF187Q5TA31 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF187Q5TA31 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF187Q5TA31 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF187Q5TA31 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RNF187Q5TA31 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF187Q5TA31 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF187Q5TA31 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF187Q5TA31 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF187Q5TA31 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF187Q5TA31 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF187Q5TA31 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF187Q5TA31 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF187Q5TA31 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF187Q5TA31 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF187Q5TA31 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF187Q5TA31 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF187Q5TA31 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF187Q5TA31 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF187Q5TA31 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF187Q5TA31 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF187Q5TA31 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF187Q5TA31 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF187Q5TA31 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF187Q5TA31 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF187Q5TA31 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF187Q5TA31 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF187Q5TA31 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF187Q5TA31 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF187Q5TA31 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF187Q5TA31 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF187Q5TA31 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF187Q5TA31 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms