Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBAP2Q5T6F2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBAP2Q5T6F2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBAP2Q5T6F2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBAP2Q5T6F2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBAP2Q5T6F2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBAP2Q5T6F2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBAP2Q5T6F2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBAP2Q5T6F2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBAP2Q5T6F2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBAP2Q5T6F2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBAP2Q5T6F2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBAP2Q5T6F2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBAP2Q5T6F2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBAP2Q5T6F2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBAP2Q5T6F2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBAP2Q5T6F2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBAP2Q5T6F2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBAP2Q5T6F2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBAP2Q5T6F2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBAP2Q5T6F2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UBAP2Q5T6F2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBAP2Q5T6F2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBAP2Q5T6F2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBAP2Q5T6F2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
UBAP2Q5T6F2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBAP2Q5T6F2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBAP2Q5T6F2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBAP2Q5T6F2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBAP2Q5T6F2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBAP2Q5T6F2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBAP2Q5T6F2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBAP2Q5T6F2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBAP2Q5T6F2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBAP2Q5T6F2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBAP2Q5T6F2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBAP2Q5T6F2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
UBAP2Q5T6F2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBAP2Q5T6F2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBAP2Q5T6F2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBAP2Q5T6F2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBAP2Q5T6F2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBAP2Q5T6F2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBAP2Q5T6F2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBAP2Q5T6F2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBAP2Q5T6F2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBAP2Q5T6F2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBAP2Q5T6F2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBAP2Q5T6F2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBAP2Q5T6F2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBAP2Q5T6F2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBAP2Q5T6F2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBAP2Q5T6F2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBAP2Q5T6F2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBAP2Q5T6F2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBAP2Q5T6F2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBAP2Q5T6F2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBAP2Q5T6F2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBAP2Q5T6F2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBAP2Q5T6F2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBAP2Q5T6F2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UBAP2Q5T6F2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBAP2Q5T6F2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBAP2Q5T6F2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBAP2Q5T6F2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBAP2Q5T6F2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBAP2Q5T6F2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBAP2Q5T6F2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBAP2Q5T6F2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBAP2Q5T6F2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UBAP2Q5T6F2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28■■■□□ 2.07
UBAP2Q5T6F2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBAP2Q5T6F2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBAP2Q5T6F2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBAP2Q5T6F2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBAP2Q5T6F2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBAP2Q5T6F2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBAP2Q5T6F2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBAP2Q5T6F2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBAP2Q5T6F2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBAP2Q5T6F2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBAP2Q5T6F2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBAP2Q5T6F2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBAP2Q5T6F2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBAP2Q5T6F2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBAP2Q5T6F2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBAP2Q5T6F2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBAP2Q5T6F2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBAP2Q5T6F2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBAP2Q5T6F2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBAP2Q5T6F2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBAP2Q5T6F2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBAP2Q5T6F2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBAP2Q5T6F2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBAP2Q5T6F2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBAP2Q5T6F2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBAP2Q5T6F2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBAP2Q5T6F2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBAP2Q5T6F2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBAP2Q5T6F2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms