Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF648Q5T619 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF648Q5T619 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF648Q5T619 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF648Q5T619 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF648Q5T619 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF648Q5T619 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF648Q5T619 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF648Q5T619 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF648Q5T619 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF648Q5T619 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF648Q5T619 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF648Q5T619 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF648Q5T619 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF648Q5T619 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF648Q5T619 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF648Q5T619 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF648Q5T619 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF648Q5T619 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF648Q5T619 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF648Q5T619 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF648Q5T619 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF648Q5T619 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF648Q5T619 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF648Q5T619 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF648Q5T619 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF648Q5T619 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF648Q5T619 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF648Q5T619 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF648Q5T619 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF648Q5T619 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF648Q5T619 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF648Q5T619 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF648Q5T619 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF648Q5T619 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF648Q5T619 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF648Q5T619 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF648Q5T619 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF648Q5T619 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF648Q5T619 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF648Q5T619 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF648Q5T619 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF648Q5T619 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF648Q5T619 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF648Q5T619 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF648Q5T619 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF648Q5T619 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF648Q5T619 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF648Q5T619 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF648Q5T619 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF648Q5T619 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF648Q5T619 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF648Q5T619 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF648Q5T619 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF648Q5T619 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF648Q5T619 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF648Q5T619 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF648Q5T619 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF648Q5T619 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF648Q5T619 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF648Q5T619 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF648Q5T619 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF648Q5T619 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF648Q5T619 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF648Q5T619 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF648Q5T619 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF648Q5T619 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF648Q5T619 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF648Q5T619 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF648Q5T619 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF648Q5T619 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF648Q5T619 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF648Q5T619 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF648Q5T619 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF648Q5T619 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF648Q5T619 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF648Q5T619 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF648Q5T619 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF648Q5T619 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF648Q5T619 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF648Q5T619 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF648Q5T619 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF648Q5T619 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF648Q5T619 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF648Q5T619 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF648Q5T619 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF648Q5T619 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF648Q5T619 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF648Q5T619 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF648Q5T619 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF648Q5T619 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZNF648Q5T619 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF648Q5T619 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF648Q5T619 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF648Q5T619 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF648Q5T619 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF648Q5T619 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF648Q5T619 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF648Q5T619 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms