Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPDYAQ5MJ70 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPDYAQ5MJ70 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPDYAQ5MJ70 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPDYAQ5MJ70 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPDYAQ5MJ70 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPDYAQ5MJ70 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPDYAQ5MJ70 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPDYAQ5MJ70 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPDYAQ5MJ70 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPDYAQ5MJ70 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPDYAQ5MJ70 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPDYAQ5MJ70 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPDYAQ5MJ70 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPDYAQ5MJ70 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPDYAQ5MJ70 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPDYAQ5MJ70 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPDYAQ5MJ70 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDYAQ5MJ70 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDYAQ5MJ70 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPDYAQ5MJ70 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPDYAQ5MJ70 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPDYAQ5MJ70 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPDYAQ5MJ70 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYAQ5MJ70 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDYAQ5MJ70 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SPDYAQ5MJ70 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPDYAQ5MJ70 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPDYAQ5MJ70 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDYAQ5MJ70 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SPDYAQ5MJ70 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPDYAQ5MJ70 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPDYAQ5MJ70 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPDYAQ5MJ70 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPDYAQ5MJ70 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPDYAQ5MJ70 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPDYAQ5MJ70 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPDYAQ5MJ70 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPDYAQ5MJ70 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPDYAQ5MJ70 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPDYAQ5MJ70 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPDYAQ5MJ70 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPDYAQ5MJ70 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SPDYAQ5MJ70 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPDYAQ5MJ70 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPDYAQ5MJ70 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPDYAQ5MJ70 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPDYAQ5MJ70 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPDYAQ5MJ70 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPDYAQ5MJ70 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPDYAQ5MJ70 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPDYAQ5MJ70 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPDYAQ5MJ70 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPDYAQ5MJ70 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPDYAQ5MJ70 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SPDYAQ5MJ70 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPDYAQ5MJ70 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPDYAQ5MJ70 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPDYAQ5MJ70 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPDYAQ5MJ70 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPDYAQ5MJ70 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPDYAQ5MJ70 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPDYAQ5MJ70 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPDYAQ5MJ70 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPDYAQ5MJ70 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPDYAQ5MJ70 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPDYAQ5MJ70 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPDYAQ5MJ70 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPDYAQ5MJ70 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPDYAQ5MJ70 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPDYAQ5MJ70 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPDYAQ5MJ70 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPDYAQ5MJ70 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPDYAQ5MJ70 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPDYAQ5MJ70 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPDYAQ5MJ70 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPDYAQ5MJ70 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPDYAQ5MJ70 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPDYAQ5MJ70 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPDYAQ5MJ70 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPDYAQ5MJ70 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPDYAQ5MJ70 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPDYAQ5MJ70 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPDYAQ5MJ70 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPDYAQ5MJ70 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPDYAQ5MJ70 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPDYAQ5MJ70 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPDYAQ5MJ70 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SPDYAQ5MJ70 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPDYAQ5MJ70 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SPDYAQ5MJ70 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPDYAQ5MJ70 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPDYAQ5MJ70 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPDYAQ5MJ70 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPDYAQ5MJ70 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPDYAQ5MJ70 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPDYAQ5MJ70 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPDYAQ5MJ70 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPDYAQ5MJ70 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPDYAQ5MJ70 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms