Protein–RNA interactions for Protein: Q5EE01

CENPW, Centromere protein W, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPWQ5EE01 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPWQ5EE01 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPWQ5EE01 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPWQ5EE01 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CENPWQ5EE01 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPWQ5EE01 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPWQ5EE01 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPWQ5EE01 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPWQ5EE01 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPWQ5EE01 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPWQ5EE01 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPWQ5EE01 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPWQ5EE01 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPWQ5EE01 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPWQ5EE01 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPWQ5EE01 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPWQ5EE01 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPWQ5EE01 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPWQ5EE01 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPWQ5EE01 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPWQ5EE01 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPWQ5EE01 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPWQ5EE01 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPWQ5EE01 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPWQ5EE01 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CENPWQ5EE01 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPWQ5EE01 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPWQ5EE01 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPWQ5EE01 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CENPWQ5EE01 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPWQ5EE01 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPWQ5EE01 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPWQ5EE01 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPWQ5EE01 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPWQ5EE01 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPWQ5EE01 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CENPWQ5EE01 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPWQ5EE01 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CENPWQ5EE01 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CENPWQ5EE01 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CENPWQ5EE01 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPWQ5EE01 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CENPWQ5EE01 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPWQ5EE01 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CENPWQ5EE01 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPWQ5EE01 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPWQ5EE01 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPWQ5EE01 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CENPWQ5EE01 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CENPWQ5EE01 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPWQ5EE01 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPWQ5EE01 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPWQ5EE01 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CENPWQ5EE01 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CENPWQ5EE01 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms