Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM41BQ5BJD5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM41BQ5BJD5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM41BQ5BJD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM41BQ5BJD5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM41BQ5BJD5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM41BQ5BJD5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM41BQ5BJD5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM41BQ5BJD5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM41BQ5BJD5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM41BQ5BJD5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM41BQ5BJD5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM41BQ5BJD5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM41BQ5BJD5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41BQ5BJD5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41BQ5BJD5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41BQ5BJD5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM41BQ5BJD5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM41BQ5BJD5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM41BQ5BJD5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM41BQ5BJD5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM41BQ5BJD5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM41BQ5BJD5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM41BQ5BJD5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM41BQ5BJD5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM41BQ5BJD5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM41BQ5BJD5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM41BQ5BJD5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM41BQ5BJD5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM41BQ5BJD5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM41BQ5BJD5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM41BQ5BJD5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM41BQ5BJD5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM41BQ5BJD5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41BQ5BJD5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM41BQ5BJD5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM41BQ5BJD5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM41BQ5BJD5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM41BQ5BJD5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM41BQ5BJD5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM41BQ5BJD5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM41BQ5BJD5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM41BQ5BJD5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM41BQ5BJD5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM41BQ5BJD5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM41BQ5BJD5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM41BQ5BJD5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM41BQ5BJD5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM41BQ5BJD5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM41BQ5BJD5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM41BQ5BJD5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM41BQ5BJD5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM41BQ5BJD5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM41BQ5BJD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM41BQ5BJD5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM41BQ5BJD5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM41BQ5BJD5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM41BQ5BJD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM41BQ5BJD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM41BQ5BJD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM41BQ5BJD5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM41BQ5BJD5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM41BQ5BJD5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM41BQ5BJD5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM41BQ5BJD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM41BQ5BJD5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM41BQ5BJD5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM41BQ5BJD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM41BQ5BJD5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM41BQ5BJD5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM41BQ5BJD5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM41BQ5BJD5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM41BQ5BJD5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM41BQ5BJD5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM41BQ5BJD5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM41BQ5BJD5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM41BQ5BJD5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM41BQ5BJD5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM41BQ5BJD5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM41BQ5BJD5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM41BQ5BJD5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM41BQ5BJD5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM41BQ5BJD5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM41BQ5BJD5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM41BQ5BJD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM41BQ5BJD5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM41BQ5BJD5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM41BQ5BJD5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM41BQ5BJD5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM41BQ5BJD5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM41BQ5BJD5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM41BQ5BJD5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM41BQ5BJD5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM41BQ5BJD5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM41BQ5BJD5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM41BQ5BJD5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM41BQ5BJD5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM41BQ5BJD5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM41BQ5BJD5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms