Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC01559Q495D7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LINC01559Q495D7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LINC01559Q495D7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LINC01559Q495D7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LINC01559Q495D7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LINC01559Q495D7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC01559Q495D7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC01559Q495D7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC01559Q495D7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC01559Q495D7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC01559Q495D7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC01559Q495D7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC01559Q495D7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC01559Q495D7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC01559Q495D7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC01559Q495D7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01559Q495D7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01559Q495D7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC01559Q495D7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC01559Q495D7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC01559Q495D7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC01559Q495D7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01559Q495D7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC01559Q495D7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01559Q495D7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01559Q495D7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01559Q495D7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC01559Q495D7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01559Q495D7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01559Q495D7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01559Q495D7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01559Q495D7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01559Q495D7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01559Q495D7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01559Q495D7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01559Q495D7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC01559Q495D7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC01559Q495D7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01559Q495D7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01559Q495D7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC01559Q495D7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC01559Q495D7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC01559Q495D7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01559Q495D7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01559Q495D7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01559Q495D7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01559Q495D7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01559Q495D7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01559Q495D7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01559Q495D7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01559Q495D7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01559Q495D7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01559Q495D7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms