Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP25-1Q3LHN0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP25-1Q3LHN0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
KRTAP25-1Q3LHN0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
KRTAP25-1Q3LHN0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP25-1Q3LHN0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP25-1Q3LHN0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP25-1Q3LHN0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP25-1Q3LHN0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP25-1Q3LHN0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP25-1Q3LHN0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP25-1Q3LHN0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP25-1Q3LHN0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP25-1Q3LHN0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KRTAP25-1Q3LHN0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP25-1Q3LHN0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
KRTAP25-1Q3LHN0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms