Protein–RNA interactions for Protein: Q1A5X7

WHAMMP3, Putative WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3Q1A5X7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
WHAMMP3Q1A5X7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
WHAMMP3Q1A5X7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
WHAMMP3Q1A5X7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
WHAMMP3Q1A5X7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
WHAMMP3Q1A5X7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
WHAMMP3Q1A5X7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
WHAMMP3Q1A5X7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
WHAMMP3Q1A5X7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
WHAMMP3Q1A5X7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
WHAMMP3Q1A5X7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
WHAMMP3Q1A5X7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
WHAMMP3Q1A5X7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
WHAMMP3Q1A5X7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
WHAMMP3Q1A5X7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
WHAMMP3Q1A5X7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
WHAMMP3Q1A5X7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
WHAMMP3Q1A5X7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
WHAMMP3Q1A5X7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
WHAMMP3Q1A5X7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
WHAMMP3Q1A5X7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
WHAMMP3Q1A5X7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
WHAMMP3Q1A5X7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
WHAMMP3Q1A5X7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
WHAMMP3Q1A5X7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
WHAMMP3Q1A5X7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
WHAMMP3Q1A5X7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
WHAMMP3Q1A5X7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
WHAMMP3Q1A5X7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
WHAMMP3Q1A5X7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
WHAMMP3Q1A5X7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
WHAMMP3Q1A5X7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
WHAMMP3Q1A5X7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
WHAMMP3Q1A5X7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
WHAMMP3Q1A5X7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
WHAMMP3Q1A5X7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
WHAMMP3Q1A5X7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
WHAMMP3Q1A5X7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
WHAMMP3Q1A5X7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
WHAMMP3Q1A5X7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
WHAMMP3Q1A5X7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
WHAMMP3Q1A5X7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
WHAMMP3Q1A5X7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
WHAMMP3Q1A5X7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
WHAMMP3Q1A5X7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
WHAMMP3Q1A5X7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
WHAMMP3Q1A5X7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
WHAMMP3Q1A5X7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WHAMMP3Q1A5X7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
WHAMMP3Q1A5X7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
WHAMMP3Q1A5X7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WHAMMP3Q1A5X7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WHAMMP3Q1A5X7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
WHAMMP3Q1A5X7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
WHAMMP3Q1A5X7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
WHAMMP3Q1A5X7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
WHAMMP3Q1A5X7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WHAMMP3Q1A5X7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WHAMMP3Q1A5X7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
WHAMMP3Q1A5X7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WHAMMP3Q1A5X7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
WHAMMP3Q1A5X7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
WHAMMP3Q1A5X7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WHAMMP3Q1A5X7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
WHAMMP3Q1A5X7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
WHAMMP3Q1A5X7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WHAMMP3Q1A5X7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
WHAMMP3Q1A5X7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
WHAMMP3Q1A5X7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
WHAMMP3Q1A5X7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
WHAMMP3Q1A5X7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
WHAMMP3Q1A5X7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
WHAMMP3Q1A5X7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WHAMMP3Q1A5X7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WHAMMP3Q1A5X7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
WHAMMP3Q1A5X7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
WHAMMP3Q1A5X7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
WHAMMP3Q1A5X7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
WHAMMP3Q1A5X7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WHAMMP3Q1A5X7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WHAMMP3Q1A5X7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WHAMMP3Q1A5X7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WHAMMP3Q1A5X7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
WHAMMP3Q1A5X7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms