Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IMPG1Q17R60 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
IMPG1Q17R60 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IMPG1Q17R60 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IMPG1Q17R60 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IMPG1Q17R60 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IMPG1Q17R60 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IMPG1Q17R60 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IMPG1Q17R60 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IMPG1Q17R60 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
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