Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRF1Q16656 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRF1Q16656 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRF1Q16656 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRF1Q16656 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRF1Q16656 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRF1Q16656 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRF1Q16656 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRF1Q16656 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRF1Q16656 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRF1Q16656 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRF1Q16656 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRF1Q16656 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NRF1Q16656 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRF1Q16656 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRF1Q16656 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRF1Q16656 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRF1Q16656 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRF1Q16656 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRF1Q16656 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRF1Q16656 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NRF1Q16656 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRF1Q16656 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRF1Q16656 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRF1Q16656 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRF1Q16656 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRF1Q16656 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRF1Q16656 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRF1Q16656 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRF1Q16656 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRF1Q16656 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRF1Q16656 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRF1Q16656 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRF1Q16656 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRF1Q16656 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRF1Q16656 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRF1Q16656 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRF1Q16656 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRF1Q16656 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRF1Q16656 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NRF1Q16656 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRF1Q16656 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRF1Q16656 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRF1Q16656 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRF1Q16656 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRF1Q16656 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRF1Q16656 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRF1Q16656 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRF1Q16656 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRF1Q16656 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRF1Q16656 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRF1Q16656 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRF1Q16656 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRF1Q16656 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRF1Q16656 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRF1Q16656 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRF1Q16656 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRF1Q16656 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRF1Q16656 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NRF1Q16656 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRF1Q16656 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRF1Q16656 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NRF1Q16656 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NRF1Q16656 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRF1Q16656 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NRF1Q16656 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NRF1Q16656 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NRF1Q16656 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
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